Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,52■■■□□ 2
Pcdh8Q7TSK3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Pcdh8Q7TSK3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,48■■□□□ 1,99
Pcdh8Q7TSK3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Pcdh8Q7TSK3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Pcdh8Q7TSK3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Pcdh8Q7TSK3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pcdh8Q7TSK3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Pcdh8Q7TSK3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Pcdh8Q7TSK3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Pcdh8Q7TSK3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Pcdh8Q7TSK3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Pcdh8Q7TSK3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Pcdh8Q7TSK3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pcdh8Q7TSK3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Pcdh8Q7TSK3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Pcdh8Q7TSK3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pcdh8Q7TSK3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Pcdh8Q7TSK3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Pcdh8Q7TSK3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Pcdh8Q7TSK3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pcdh8Q7TSK3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Pcdh8Q7TSK3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Pcdh8Q7TSK3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Pcdh8Q7TSK3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Pcdh8Q7TSK3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Pcdh8Q7TSK3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Pcdh8Q7TSK3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Pcdh8Q7TSK3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Pcdh8Q7TSK3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Pcdh8Q7TSK3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Pcdh8Q7TSK3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Pcdh8Q7TSK3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Pcdh8Q7TSK3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Pcdh8Q7TSK3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Pcdh8Q7TSK3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Pcdh8Q7TSK3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Pcdh8Q7TSK3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Pcdh8Q7TSK3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Pcdh8Q7TSK3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Pcdh8Q7TSK3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Pcdh8Q7TSK3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Pcdh8Q7TSK3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Pcdh8Q7TSK3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Pcdh8Q7TSK3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pcdh8Q7TSK3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Pcdh8Q7TSK3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Pcdh8Q7TSK3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Pcdh8Q7TSK3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Pcdh8Q7TSK3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Pcdh8Q7TSK3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Pcdh8Q7TSK3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Pcdh8Q7TSK3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Pcdh8Q7TSK3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Pcdh8Q7TSK3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Pcdh8Q7TSK3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Pcdh8Q7TSK3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Pcdh8Q7TSK3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Pcdh8Q7TSK3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Pcdh8Q7TSK3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Pcdh8Q7TSK3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Pcdh8Q7TSK3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Pcdh8Q7TSK3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Pcdh8Q7TSK3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Pcdh8Q7TSK3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Pcdh8Q7TSK3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Pcdh8Q7TSK3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Pcdh8Q7TSK3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Pcdh8Q7TSK3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Pcdh8Q7TSK3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Pcdh8Q7TSK3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Pcdh8Q7TSK3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Pcdh8Q7TSK3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Pcdh8Q7TSK3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Pcdh8Q7TSK3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Pcdh8Q7TSK3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Pcdh8Q7TSK3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Pcdh8Q7TSK3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Pcdh8Q7TSK3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Pcdh8Q7TSK3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Pcdh8Q7TSK3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Pcdh8Q7TSK3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Pcdh8Q7TSK3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Pcdh8Q7TSK3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Pcdh8Q7TSK3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Pcdh8Q7TSK3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Pcdh8Q7TSK3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Pcdh8Q7TSK3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Pcdh8Q7TSK3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Pcdh8Q7TSK3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Pcdh8Q7TSK3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Pcdh8Q7TSK3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Pcdh8Q7TSK3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Pcdh8Q7TSK3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Pcdh8Q7TSK3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Pcdh8Q7TSK3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms