Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LnpkQ7TQ95 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LnpkQ7TQ95 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LnpkQ7TQ95 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LnpkQ7TQ95 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LnpkQ7TQ95 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LnpkQ7TQ95 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LnpkQ7TQ95 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LnpkQ7TQ95 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LnpkQ7TQ95 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LnpkQ7TQ95 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LnpkQ7TQ95 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LnpkQ7TQ95 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LnpkQ7TQ95 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LnpkQ7TQ95 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LnpkQ7TQ95 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LnpkQ7TQ95 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LnpkQ7TQ95 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LnpkQ7TQ95 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LnpkQ7TQ95 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LnpkQ7TQ95 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LnpkQ7TQ95 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LnpkQ7TQ95 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LnpkQ7TQ95 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LnpkQ7TQ95 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LnpkQ7TQ95 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LnpkQ7TQ95 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LnpkQ7TQ95 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LnpkQ7TQ95 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LnpkQ7TQ95 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LnpkQ7TQ95 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LnpkQ7TQ95 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LnpkQ7TQ95 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LnpkQ7TQ95 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LnpkQ7TQ95 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LnpkQ7TQ95 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LnpkQ7TQ95 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LnpkQ7TQ95 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LnpkQ7TQ95 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LnpkQ7TQ95 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LnpkQ7TQ95 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LnpkQ7TQ95 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LnpkQ7TQ95 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LnpkQ7TQ95 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LnpkQ7TQ95 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LnpkQ7TQ95 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LnpkQ7TQ95 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LnpkQ7TQ95 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LnpkQ7TQ95 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LnpkQ7TQ95 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LnpkQ7TQ95 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LnpkQ7TQ95 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LnpkQ7TQ95 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LnpkQ7TQ95 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LnpkQ7TQ95 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LnpkQ7TQ95 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LnpkQ7TQ95 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LnpkQ7TQ95 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LnpkQ7TQ95 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LnpkQ7TQ95 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LnpkQ7TQ95 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LnpkQ7TQ95 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LnpkQ7TQ95 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LnpkQ7TQ95 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LnpkQ7TQ95 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LnpkQ7TQ95 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LnpkQ7TQ95 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LnpkQ7TQ95 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LnpkQ7TQ95 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LnpkQ7TQ95 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LnpkQ7TQ95 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LnpkQ7TQ95 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LnpkQ7TQ95 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LnpkQ7TQ95 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LnpkQ7TQ95 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LnpkQ7TQ95 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LnpkQ7TQ95 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LnpkQ7TQ95 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LnpkQ7TQ95 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LnpkQ7TQ95 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LnpkQ7TQ95 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LnpkQ7TQ95 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LnpkQ7TQ95 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LnpkQ7TQ95 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LnpkQ7TQ95 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LnpkQ7TQ95 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LnpkQ7TQ95 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LnpkQ7TQ95 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LnpkQ7TQ95 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LnpkQ7TQ95 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LnpkQ7TQ95 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LnpkQ7TQ95 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LnpkQ7TQ95 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LnpkQ7TQ95 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LnpkQ7TQ95 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LnpkQ7TQ95 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LnpkQ7TQ95 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LnpkQ7TQ95 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LnpkQ7TQ95 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LnpkQ7TQ95 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms