Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNV7

Defb38, Beta-defensin 38, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb38Q7TNV7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defb38Q7TNV7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defb38Q7TNV7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defb38Q7TNV7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defb38Q7TNV7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defb38Q7TNV7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defb38Q7TNV7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defb38Q7TNV7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defb38Q7TNV7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defb38Q7TNV7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defb38Q7TNV7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defb38Q7TNV7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defb38Q7TNV7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defb38Q7TNV7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb38Q7TNV7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb38Q7TNV7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defb38Q7TNV7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defb38Q7TNV7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb38Q7TNV7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb38Q7TNV7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defb38Q7TNV7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb38Q7TNV7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defb38Q7TNV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defb38Q7TNV7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb38Q7TNV7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb38Q7TNV7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defb38Q7TNV7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb38Q7TNV7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defb38Q7TNV7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defb38Q7TNV7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb38Q7TNV7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defb38Q7TNV7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defb38Q7TNV7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defb38Q7TNV7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defb38Q7TNV7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defb38Q7TNV7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defb38Q7TNV7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defb38Q7TNV7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defb38Q7TNV7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defb38Q7TNV7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defb38Q7TNV7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defb38Q7TNV7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb38Q7TNV7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb38Q7TNV7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb38Q7TNV7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb38Q7TNV7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb38Q7TNV7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defb38Q7TNV7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defb38Q7TNV7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms