Protein–RNA interactions for Protein: Q7M750

Opalin, Opalin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpalinQ7M750 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OpalinQ7M750 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OpalinQ7M750 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OpalinQ7M750 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OpalinQ7M750 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OpalinQ7M750 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OpalinQ7M750 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OpalinQ7M750 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OpalinQ7M750 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OpalinQ7M750 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OpalinQ7M750 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OpalinQ7M750 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OpalinQ7M750 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OpalinQ7M750 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OpalinQ7M750 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OpalinQ7M750 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OpalinQ7M750 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OpalinQ7M750 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OpalinQ7M750 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OpalinQ7M750 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OpalinQ7M750 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OpalinQ7M750 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OpalinQ7M750 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OpalinQ7M750 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OpalinQ7M750 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OpalinQ7M750 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OpalinQ7M750 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OpalinQ7M750 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OpalinQ7M750 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OpalinQ7M750 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OpalinQ7M750 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OpalinQ7M750 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OpalinQ7M750 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OpalinQ7M750 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
OpalinQ7M750 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OpalinQ7M750 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OpalinQ7M750 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OpalinQ7M750 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
OpalinQ7M750 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
OpalinQ7M750 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OpalinQ7M750 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OpalinQ7M750 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OpalinQ7M750 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OpalinQ7M750 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OpalinQ7M750 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OpalinQ7M750 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OpalinQ7M750 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OpalinQ7M750 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OpalinQ7M750 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OpalinQ7M750 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OpalinQ7M750 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OpalinQ7M750 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OpalinQ7M750 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OpalinQ7M750 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OpalinQ7M750 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OpalinQ7M750 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
OpalinQ7M750 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OpalinQ7M750 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OpalinQ7M750 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OpalinQ7M750 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OpalinQ7M750 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OpalinQ7M750 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OpalinQ7M750 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OpalinQ7M750 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OpalinQ7M750 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OpalinQ7M750 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OpalinQ7M750 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OpalinQ7M750 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OpalinQ7M750 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OpalinQ7M750 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
OpalinQ7M750 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OpalinQ7M750 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
OpalinQ7M750 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
OpalinQ7M750 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OpalinQ7M750 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OpalinQ7M750 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OpalinQ7M750 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OpalinQ7M750 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OpalinQ7M750 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OpalinQ7M750 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OpalinQ7M750 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OpalinQ7M750 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OpalinQ7M750 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OpalinQ7M750 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OpalinQ7M750 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OpalinQ7M750 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OpalinQ7M750 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OpalinQ7M750 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OpalinQ7M750 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms