Protein–RNA interactions for Protein: Q7M750

Opalin, Opalin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpalinQ7M750 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
OpalinQ7M750 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
OpalinQ7M750 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
OpalinQ7M750 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
OpalinQ7M750 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
OpalinQ7M750 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,2■■□□□ 1,14
OpalinQ7M750 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
OpalinQ7M750 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
OpalinQ7M750 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
OpalinQ7M750 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
OpalinQ7M750 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
OpalinQ7M750 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
OpalinQ7M750 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,1■■□□□ 1,13
OpalinQ7M750 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
OpalinQ7M750 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
OpalinQ7M750 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,04■■□□□ 1,12
OpalinQ7M750 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
OpalinQ7M750 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
OpalinQ7M750 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
OpalinQ7M750 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
OpalinQ7M750 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
OpalinQ7M750 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
OpalinQ7M750 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
OpalinQ7M750 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
OpalinQ7M750 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
OpalinQ7M750 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
OpalinQ7M750 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
OpalinQ7M750 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,84■■□□□ 1,09
OpalinQ7M750 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
OpalinQ7M750 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
OpalinQ7M750 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
OpalinQ7M750 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
OpalinQ7M750 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
OpalinQ7M750 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21,76■■□□□ 1,07
OpalinQ7M750 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
OpalinQ7M750 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
OpalinQ7M750 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
OpalinQ7M750 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
OpalinQ7M750 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
OpalinQ7M750 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,63■■□□□ 1,05
OpalinQ7M750 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
OpalinQ7M750 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
OpalinQ7M750 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
OpalinQ7M750 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
OpalinQ7M750 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
OpalinQ7M750 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
OpalinQ7M750 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
OpalinQ7M750 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
OpalinQ7M750 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
OpalinQ7M750 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
OpalinQ7M750 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
OpalinQ7M750 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
OpalinQ7M750 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,49■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,46■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21,46■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
OpalinQ7M750 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
OpalinQ7M750 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
OpalinQ7M750 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,39■■□□□ 1,02
OpalinQ7M750 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
OpalinQ7M750 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
OpalinQ7M750 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,39■■□□□ 1,01
OpalinQ7M750 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
OpalinQ7M750 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
OpalinQ7M750 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
OpalinQ7M750 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
OpalinQ7M750 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
OpalinQ7M750 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
OpalinQ7M750 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
OpalinQ7M750 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
OpalinQ7M750 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21,26■□□□□ 0,99
OpalinQ7M750 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,26■□□□□ 0,99
OpalinQ7M750 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
OpalinQ7M750 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
OpalinQ7M750 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
OpalinQ7M750 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
OpalinQ7M750 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
OpalinQ7M750 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
OpalinQ7M750 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
OpalinQ7M750 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
OpalinQ7M750 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
OpalinQ7M750 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
OpalinQ7M750 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
OpalinQ7M750 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
OpalinQ7M750 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
OpalinQ7M750 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
OpalinQ7M750 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
OpalinQ7M750 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
OpalinQ7M750 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
OpalinQ7M750 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
OpalinQ7M750 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
OpalinQ7M750 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms