Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Scn4bQ7M729 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scn4bQ7M729 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Scn4bQ7M729 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Scn4bQ7M729 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn4bQ7M729 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Scn4bQ7M729 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn4bQ7M729 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scn4bQ7M729 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Scn4bQ7M729 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn4bQ7M729 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn4bQ7M729 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn4bQ7M729 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn4bQ7M729 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn4bQ7M729 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scn4bQ7M729 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn4bQ7M729 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scn4bQ7M729 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scn4bQ7M729 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn4bQ7M729 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scn4bQ7M729 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scn4bQ7M729 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn4bQ7M729 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scn4bQ7M729 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Scn4bQ7M729 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scn4bQ7M729 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scn4bQ7M729 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scn4bQ7M729 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scn4bQ7M729 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scn4bQ7M729 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4bQ7M729 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4bQ7M729 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scn4bQ7M729 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scn4bQ7M729 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn4bQ7M729 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn4bQ7M729 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Scn4bQ7M729 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scn4bQ7M729 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Scn4bQ7M729 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scn4bQ7M729 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scn4bQ7M729 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scn4bQ7M729 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scn4bQ7M729 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scn4bQ7M729 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn4bQ7M729 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scn4bQ7M729 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scn4bQ7M729 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scn4bQ7M729 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scn4bQ7M729 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn4bQ7M729 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn4bQ7M729 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn4bQ7M729 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn4bQ7M729 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn4bQ7M729 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Scn4bQ7M729 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4bQ7M729 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn4bQ7M729 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scn4bQ7M729 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scn4bQ7M729 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scn4bQ7M729 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scn4bQ7M729 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn4bQ7M729 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Scn4bQ7M729 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn4bQ7M729 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn4bQ7M729 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn4bQ7M729 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn4bQ7M729 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn4bQ7M729 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn4bQ7M729 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn4bQ7M729 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn4bQ7M729 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn4bQ7M729 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn4bQ7M729 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scn4bQ7M729 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn4bQ7M729 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn4bQ7M729 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4bQ7M729 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4bQ7M729 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4bQ7M729 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn4bQ7M729 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scn4bQ7M729 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Scn4bQ7M729 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4bQ7M729 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4bQ7M729 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scn4bQ7M729 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Scn4bQ7M729 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn4bQ7M729 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4bQ7M729 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4bQ7M729 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn4bQ7M729 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms