Protein–RNA interactions for Protein: Q76LL6

Fhod3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod3Q76LL6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42,3■■■■■ 4,36
Fhod3Q76LL6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,21■■■■■ 4,35
Fhod3Q76LL6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC42,21■■■■■ 4,35
Fhod3Q76LL6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,2■■■■■ 4,35
Fhod3Q76LL6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42,19■■■■■ 4,34
Fhod3Q76LL6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,14■■■■■ 4,34
Fhod3Q76LL6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42,14■■■■■ 4,34
Fhod3Q76LL6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,1■■■■■ 4,33
Fhod3Q76LL6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,08■■■■■ 4,33
Fhod3Q76LL6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,07■■■■■ 4,32
Fhod3Q76LL6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,05■■■■■ 4,32
Fhod3Q76LL6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42,03■■■■■ 4,32
Fhod3Q76LL6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42,01■■■■■ 4,32
Fhod3Q76LL6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41,97■■■■■ 4,31
Fhod3Q76LL6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
Fhod3Q76LL6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41,93■■■■■ 4,3
Fhod3Q76LL6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,86■■■■■ 4,29
Fhod3Q76LL6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,84■■■■■ 4,29
Fhod3Q76LL6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,82■■■■■ 4,29
Fhod3Q76LL6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41,82■■■■■ 4,28
Fhod3Q76LL6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,8■■■■■ 4,28
Fhod3Q76LL6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,72■■■■■ 4,27
Fhod3Q76LL6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,71■■■■■ 4,27
Fhod3Q76LL6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,55■■■■■ 4,24
Fhod3Q76LL6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Fhod3Q76LL6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC41,47■■■■■ 4,23
Fhod3Q76LL6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC41,43■■■■■ 4,22
Fhod3Q76LL6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC41,42■■■■■ 4,22
Fhod3Q76LL6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
Fhod3Q76LL6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,34■■■■■ 4,21
Fhod3Q76LL6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Fhod3Q76LL6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Fhod3Q76LL6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41,32■■■■■ 4,21
Fhod3Q76LL6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Fhod3Q76LL6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,2
Fhod3Q76LL6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,25■■■■■ 4,19
Fhod3Q76LL6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Fhod3Q76LL6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41,16■■■■■ 4,18
Fhod3Q76LL6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41,14■■■■■ 4,18
Fhod3Q76LL6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41,13■■■■■ 4,17
Fhod3Q76LL6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Fhod3Q76LL6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41,12■■■■■ 4,17
Fhod3Q76LL6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Fhod3Q76LL6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
Fhod3Q76LL6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,16
Fhod3Q76LL6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Fhod3Q76LL6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Fhod3Q76LL6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Fhod3Q76LL6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,97■■■■■ 4,15
Fhod3Q76LL6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Fhod3Q76LL6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Fhod3Q76LL6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Fhod3Q76LL6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40,84■■■■■ 4,13
Fhod3Q76LL6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Fhod3Q76LL6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Fhod3Q76LL6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40,84■■■■■ 4,13
Fhod3Q76LL6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC40,82■■■■■ 4,12
Fhod3Q76LL6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Fhod3Q76LL6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Fhod3Q76LL6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Fhod3Q76LL6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Fhod3Q76LL6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC40,69■■■■■ 4,1
Fhod3Q76LL6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Fhod3Q76LL6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Fhod3Q76LL6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Fhod3Q76LL6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Fhod3Q76LL6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,63■■■■■ 4,1
Fhod3Q76LL6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Fhod3Q76LL6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Fhod3Q76LL6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,54■■■■■ 4,08
Fhod3Q76LL6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Fhod3Q76LL6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC40,52■■■■■ 4,08
Fhod3Q76LL6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Fhod3Q76LL6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Fhod3Q76LL6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Fhod3Q76LL6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Fhod3Q76LL6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Fhod3Q76LL6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Fhod3Q76LL6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40,26■■■■■ 4,04
Fhod3Q76LL6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,24■■■■■ 4,03
Fhod3Q76LL6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
Fhod3Q76LL6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,18■■■■■ 4,02
Fhod3Q76LL6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Fhod3Q76LL6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40,17■■■■■ 4,02
Fhod3Q76LL6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Fhod3Q76LL6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,17■■■■■ 4,02
Fhod3Q76LL6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40,16■■■■■ 4,02
Fhod3Q76LL6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Fhod3Q76LL6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Fhod3Q76LL6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Fhod3Q76LL6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,09■■■■■ 4,01
Fhod3Q76LL6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC40,08■■■■■ 4,01
Fhod3Q76LL6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC40,08■■■■■ 4,01
Fhod3Q76LL6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40,08■■■■■ 4,01
Fhod3Q76LL6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4,01
Fhod3Q76LL6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4
Fhod3Q76LL6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC40,05■■■■■ 4
Fhod3Q76LL6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Fhod3Q76LL6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40,02■■■■■ 4
Fhod3Q76LL6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40,01■■■■□ 3,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms