Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Glis3Q6XP49 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Glis3Q6XP49 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Glis3Q6XP49 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Glis3Q6XP49 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Glis3Q6XP49 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Glis3Q6XP49 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Glis3Q6XP49 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Glis3Q6XP49 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Glis3Q6XP49 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Glis3Q6XP49 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Glis3Q6XP49 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Glis3Q6XP49 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Glis3Q6XP49 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Glis3Q6XP49 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Glis3Q6XP49 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Glis3Q6XP49 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Glis3Q6XP49 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Glis3Q6XP49 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Glis3Q6XP49 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Glis3Q6XP49 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Glis3Q6XP49 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Glis3Q6XP49 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Glis3Q6XP49 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Glis3Q6XP49 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Glis3Q6XP49 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Glis3Q6XP49 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Glis3Q6XP49 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Glis3Q6XP49 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Glis3Q6XP49 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Glis3Q6XP49 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Glis3Q6XP49 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Glis3Q6XP49 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Glis3Q6XP49 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Glis3Q6XP49 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Glis3Q6XP49 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Glis3Q6XP49 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Glis3Q6XP49 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Glis3Q6XP49 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Glis3Q6XP49 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Glis3Q6XP49 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Glis3Q6XP49 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Glis3Q6XP49 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Glis3Q6XP49 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Glis3Q6XP49 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Glis3Q6XP49 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Glis3Q6XP49 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Glis3Q6XP49 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Glis3Q6XP49 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Glis3Q6XP49 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Glis3Q6XP49 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Glis3Q6XP49 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Glis3Q6XP49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Glis3Q6XP49 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Glis3Q6XP49 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Glis3Q6XP49 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Glis3Q6XP49 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Glis3Q6XP49 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Glis3Q6XP49 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Glis3Q6XP49 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Glis3Q6XP49 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Glis3Q6XP49 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Glis3Q6XP49 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Glis3Q6XP49 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Glis3Q6XP49 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Glis3Q6XP49 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Glis3Q6XP49 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Glis3Q6XP49 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Glis3Q6XP49 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Glis3Q6XP49 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Glis3Q6XP49 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Glis3Q6XP49 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Glis3Q6XP49 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Glis3Q6XP49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Glis3Q6XP49 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Glis3Q6XP49 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Glis3Q6XP49 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Glis3Q6XP49 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Glis3Q6XP49 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Glis3Q6XP49 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Glis3Q6XP49 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Glis3Q6XP49 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Glis3Q6XP49 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Glis3Q6XP49 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Glis3Q6XP49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Glis3Q6XP49 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Glis3Q6XP49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Glis3Q6XP49 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Glis3Q6XP49 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Glis3Q6XP49 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Glis3Q6XP49 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Glis3Q6XP49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Glis3Q6XP49 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Glis3Q6XP49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Glis3Q6XP49 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Glis3Q6XP49 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Glis3Q6XP49 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Glis3Q6XP49 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Glis3Q6XP49 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Glis3Q6XP49 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms