Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slc9c1Q6UJY2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Slc9c1Q6UJY2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Slc9c1Q6UJY2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slc9c1Q6UJY2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Slc9c1Q6UJY2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slc9c1Q6UJY2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slc9c1Q6UJY2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slc9c1Q6UJY2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Slc9c1Q6UJY2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Slc9c1Q6UJY2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slc9c1Q6UJY2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Slc9c1Q6UJY2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slc9c1Q6UJY2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Slc9c1Q6UJY2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slc9c1Q6UJY2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Slc9c1Q6UJY2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Slc9c1Q6UJY2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Slc9c1Q6UJY2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Slc9c1Q6UJY2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slc9c1Q6UJY2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Slc9c1Q6UJY2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slc9c1Q6UJY2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slc9c1Q6UJY2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slc9c1Q6UJY2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Slc9c1Q6UJY2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Slc9c1Q6UJY2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Slc9c1Q6UJY2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slc9c1Q6UJY2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Slc9c1Q6UJY2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Slc9c1Q6UJY2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Slc9c1Q6UJY2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Slc9c1Q6UJY2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Slc9c1Q6UJY2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Slc9c1Q6UJY2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Slc9c1Q6UJY2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Slc9c1Q6UJY2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Slc9c1Q6UJY2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Slc9c1Q6UJY2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Slc9c1Q6UJY2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Slc9c1Q6UJY2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Slc9c1Q6UJY2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Slc9c1Q6UJY2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Slc9c1Q6UJY2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Slc9c1Q6UJY2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Slc9c1Q6UJY2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Slc9c1Q6UJY2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Slc9c1Q6UJY2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Slc9c1Q6UJY2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Slc9c1Q6UJY2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Slc9c1Q6UJY2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Slc9c1Q6UJY2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Slc9c1Q6UJY2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Slc9c1Q6UJY2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Slc9c1Q6UJY2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Slc9c1Q6UJY2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Slc9c1Q6UJY2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Slc9c1Q6UJY2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Slc9c1Q6UJY2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Slc9c1Q6UJY2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Slc9c1Q6UJY2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Slc9c1Q6UJY2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Slc9c1Q6UJY2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Slc9c1Q6UJY2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Slc9c1Q6UJY2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Slc9c1Q6UJY2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Slc9c1Q6UJY2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Slc9c1Q6UJY2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Slc9c1Q6UJY2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Slc9c1Q6UJY2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Slc9c1Q6UJY2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Slc9c1Q6UJY2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Slc9c1Q6UJY2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Slc9c1Q6UJY2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Slc9c1Q6UJY2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Slc9c1Q6UJY2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Slc9c1Q6UJY2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Slc9c1Q6UJY2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Slc9c1Q6UJY2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Slc9c1Q6UJY2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Slc9c1Q6UJY2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Slc9c1Q6UJY2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Slc9c1Q6UJY2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Slc9c1Q6UJY2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Slc9c1Q6UJY2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Slc9c1Q6UJY2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Slc9c1Q6UJY2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Slc9c1Q6UJY2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Slc9c1Q6UJY2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Slc9c1Q6UJY2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Slc9c1Q6UJY2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Slc9c1Q6UJY2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Slc9c1Q6UJY2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Slc9c1Q6UJY2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Slc9c1Q6UJY2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Slc9c1Q6UJY2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Slc9c1Q6UJY2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms