Protein–RNA interactions for Protein: Q6R653

Unc5cl, UNC5C-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Unc5clQ6R653 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Unc5clQ6R653 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Unc5clQ6R653 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,97■■■■□ 3,19
Unc5clQ6R653 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Unc5clQ6R653 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Unc5clQ6R653 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,94■■■■□ 3,18
Unc5clQ6R653 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Unc5clQ6R653 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Unc5clQ6R653 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Unc5clQ6R653 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Unc5clQ6R653 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Unc5clQ6R653 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Unc5clQ6R653 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
Unc5clQ6R653 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Unc5clQ6R653 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,75■■■■□ 3,15
Unc5clQ6R653 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,74■■■■□ 3,15
Unc5clQ6R653 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Unc5clQ6R653 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Unc5clQ6R653 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Unc5clQ6R653 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Unc5clQ6R653 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Unc5clQ6R653 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,65■■■■□ 3,14
Unc5clQ6R653 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Unc5clQ6R653 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Unc5clQ6R653 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Unc5clQ6R653 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
Unc5clQ6R653 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Unc5clQ6R653 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Unc5clQ6R653 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34,46■■■■□ 3,11
Unc5clQ6R653 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Unc5clQ6R653 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Unc5clQ6R653 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Unc5clQ6R653 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Unc5clQ6R653 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Unc5clQ6R653 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Unc5clQ6R653 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Unc5clQ6R653 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Unc5clQ6R653 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Unc5clQ6R653 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Unc5clQ6R653 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Unc5clQ6R653 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Unc5clQ6R653 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Unc5clQ6R653 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Unc5clQ6R653 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Unc5clQ6R653 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Unc5clQ6R653 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Unc5clQ6R653 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Unc5clQ6R653 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Unc5clQ6R653 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Unc5clQ6R653 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Unc5clQ6R653 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Unc5clQ6R653 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Unc5clQ6R653 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Unc5clQ6R653 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Unc5clQ6R653 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Unc5clQ6R653 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Unc5clQ6R653 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Unc5clQ6R653 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Unc5clQ6R653 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Unc5clQ6R653 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
Unc5clQ6R653 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Unc5clQ6R653 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Unc5clQ6R653 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Unc5clQ6R653 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Unc5clQ6R653 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
Unc5clQ6R653 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Unc5clQ6R653 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Unc5clQ6R653 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,76■■■■□ 3
Unc5clQ6R653 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Unc5clQ6R653 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Unc5clQ6R653 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Unc5clQ6R653 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Unc5clQ6R653 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Unc5clQ6R653 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Unc5clQ6R653 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Unc5clQ6R653 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Unc5clQ6R653 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Unc5clQ6R653 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Unc5clQ6R653 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Unc5clQ6R653 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,54■■■□□ 2,96
Unc5clQ6R653 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Unc5clQ6R653 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,49■■■□□ 2,95
Unc5clQ6R653 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Unc5clQ6R653 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
Unc5clQ6R653 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Unc5clQ6R653 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
Unc5clQ6R653 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Unc5clQ6R653 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Unc5clQ6R653 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Unc5clQ6R653 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Unc5clQ6R653 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Unc5clQ6R653 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Unc5clQ6R653 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Unc5clQ6R653 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Unc5clQ6R653 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
Unc5clQ6R653 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,26■■■□□ 2,91
Unc5clQ6R653 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Unc5clQ6R653 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Unc5clQ6R653 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Unc5clQ6R653 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,4 ms