Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Snx13Q6PHS6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Snx13Q6PHS6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Snx13Q6PHS6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Snx13Q6PHS6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Snx13Q6PHS6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Snx13Q6PHS6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Snx13Q6PHS6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Snx13Q6PHS6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Snx13Q6PHS6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Snx13Q6PHS6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Snx13Q6PHS6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Snx13Q6PHS6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Snx13Q6PHS6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Snx13Q6PHS6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Snx13Q6PHS6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Snx13Q6PHS6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Snx13Q6PHS6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Snx13Q6PHS6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Snx13Q6PHS6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Snx13Q6PHS6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Snx13Q6PHS6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Snx13Q6PHS6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Snx13Q6PHS6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Snx13Q6PHS6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Snx13Q6PHS6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Snx13Q6PHS6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Snx13Q6PHS6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Snx13Q6PHS6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Snx13Q6PHS6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Snx13Q6PHS6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Snx13Q6PHS6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Snx13Q6PHS6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Snx13Q6PHS6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Snx13Q6PHS6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Snx13Q6PHS6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Snx13Q6PHS6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Snx13Q6PHS6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Snx13Q6PHS6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Snx13Q6PHS6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Snx13Q6PHS6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Snx13Q6PHS6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Snx13Q6PHS6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Snx13Q6PHS6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Snx13Q6PHS6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Snx13Q6PHS6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Snx13Q6PHS6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Snx13Q6PHS6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snx13Q6PHS6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Snx13Q6PHS6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Snx13Q6PHS6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Snx13Q6PHS6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Snx13Q6PHS6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Snx13Q6PHS6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Snx13Q6PHS6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Snx13Q6PHS6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Snx13Q6PHS6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Snx13Q6PHS6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snx13Q6PHS6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snx13Q6PHS6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Snx13Q6PHS6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snx13Q6PHS6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Snx13Q6PHS6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snx13Q6PHS6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snx13Q6PHS6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snx13Q6PHS6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Snx13Q6PHS6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Snx13Q6PHS6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Snx13Q6PHS6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Snx13Q6PHS6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snx13Q6PHS6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snx13Q6PHS6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snx13Q6PHS6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Snx13Q6PHS6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snx13Q6PHS6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snx13Q6PHS6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snx13Q6PHS6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Snx13Q6PHS6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Snx13Q6PHS6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snx13Q6PHS6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snx13Q6PHS6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Snx13Q6PHS6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx13Q6PHS6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx13Q6PHS6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx13Q6PHS6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx13Q6PHS6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx13Q6PHS6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Snx13Q6PHS6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Snx13Q6PHS6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snx13Q6PHS6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Snx13Q6PHS6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Snx13Q6PHS6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Snx13Q6PHS6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Snx13Q6PHS6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Snx13Q6PHS6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snx13Q6PHS6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snx13Q6PHS6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snx13Q6PHS6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Snx13Q6PHS6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snx13Q6PHS6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms