Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
GmipQ6PGG2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,23■■■□□ 2,43
GmipQ6PGG2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,23■■■□□ 2,43
GmipQ6PGG2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
GmipQ6PGG2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
GmipQ6PGG2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
GmipQ6PGG2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
GmipQ6PGG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
GmipQ6PGG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
GmipQ6PGG2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
GmipQ6PGG2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,41
GmipQ6PGG2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
GmipQ6PGG2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,07■■■□□ 2,4
GmipQ6PGG2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
GmipQ6PGG2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
GmipQ6PGG2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
GmipQ6PGG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
GmipQ6PGG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
GmipQ6PGG2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
GmipQ6PGG2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
GmipQ6PGG2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,96■■■□□ 2,39
GmipQ6PGG2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
GmipQ6PGG2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
GmipQ6PGG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
GmipQ6PGG2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
GmipQ6PGG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,9■■■□□ 2,38
GmipQ6PGG2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
GmipQ6PGG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
GmipQ6PGG2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
GmipQ6PGG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
GmipQ6PGG2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
GmipQ6PGG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
GmipQ6PGG2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
GmipQ6PGG2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
GmipQ6PGG2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
GmipQ6PGG2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
GmipQ6PGG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
GmipQ6PGG2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
GmipQ6PGG2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
GmipQ6PGG2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
GmipQ6PGG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
GmipQ6PGG2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
GmipQ6PGG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
GmipQ6PGG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
GmipQ6PGG2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
GmipQ6PGG2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
GmipQ6PGG2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
GmipQ6PGG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
GmipQ6PGG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
GmipQ6PGG2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,51■■■□□ 2,31
GmipQ6PGG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
GmipQ6PGG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
GmipQ6PGG2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
GmipQ6PGG2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
GmipQ6PGG2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
GmipQ6PGG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
GmipQ6PGG2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
GmipQ6PGG2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
GmipQ6PGG2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
GmipQ6PGG2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
GmipQ6PGG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
GmipQ6PGG2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
GmipQ6PGG2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
GmipQ6PGG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
GmipQ6PGG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
GmipQ6PGG2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,27■■■□□ 2,28
GmipQ6PGG2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
GmipQ6PGG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
GmipQ6PGG2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
GmipQ6PGG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
GmipQ6PGG2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
GmipQ6PGG2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
GmipQ6PGG2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
GmipQ6PGG2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
GmipQ6PGG2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
GmipQ6PGG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
GmipQ6PGG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
GmipQ6PGG2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
GmipQ6PGG2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
GmipQ6PGG2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29■■■□□ 2,23
GmipQ6PGG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
GmipQ6PGG2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
GmipQ6PGG2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
GmipQ6PGG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
GmipQ6PGG2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
GmipQ6PGG2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
GmipQ6PGG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
GmipQ6PGG2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
GmipQ6PGG2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,91■■■□□ 2,22
GmipQ6PGG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
GmipQ6PGG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
GmipQ6PGG2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
GmipQ6PGG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
GmipQ6PGG2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
GmipQ6PGG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
GmipQ6PGG2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
GmipQ6PGG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,2
GmipQ6PGG2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
GmipQ6PGG2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
GmipQ6PGG2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms