Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GmipQ6PGG2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GmipQ6PGG2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GmipQ6PGG2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GmipQ6PGG2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GmipQ6PGG2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GmipQ6PGG2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GmipQ6PGG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GmipQ6PGG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GmipQ6PGG2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GmipQ6PGG2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GmipQ6PGG2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GmipQ6PGG2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GmipQ6PGG2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GmipQ6PGG2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GmipQ6PGG2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GmipQ6PGG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GmipQ6PGG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GmipQ6PGG2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GmipQ6PGG2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GmipQ6PGG2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GmipQ6PGG2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GmipQ6PGG2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GmipQ6PGG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GmipQ6PGG2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GmipQ6PGG2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GmipQ6PGG2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GmipQ6PGG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GmipQ6PGG2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GmipQ6PGG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GmipQ6PGG2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GmipQ6PGG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GmipQ6PGG2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GmipQ6PGG2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GmipQ6PGG2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GmipQ6PGG2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GmipQ6PGG2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GmipQ6PGG2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GmipQ6PGG2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GmipQ6PGG2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GmipQ6PGG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GmipQ6PGG2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GmipQ6PGG2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GmipQ6PGG2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GmipQ6PGG2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GmipQ6PGG2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GmipQ6PGG2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GmipQ6PGG2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GmipQ6PGG2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GmipQ6PGG2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GmipQ6PGG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GmipQ6PGG2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GmipQ6PGG2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GmipQ6PGG2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GmipQ6PGG2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GmipQ6PGG2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GmipQ6PGG2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GmipQ6PGG2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GmipQ6PGG2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GmipQ6PGG2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GmipQ6PGG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GmipQ6PGG2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GmipQ6PGG2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GmipQ6PGG2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GmipQ6PGG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GmipQ6PGG2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GmipQ6PGG2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GmipQ6PGG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GmipQ6PGG2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GmipQ6PGG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GmipQ6PGG2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GmipQ6PGG2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GmipQ6PGG2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GmipQ6PGG2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GmipQ6PGG2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GmipQ6PGG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GmipQ6PGG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GmipQ6PGG2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GmipQ6PGG2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GmipQ6PGG2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GmipQ6PGG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GmipQ6PGG2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GmipQ6PGG2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GmipQ6PGG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GmipQ6PGG2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GmipQ6PGG2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GmipQ6PGG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GmipQ6PGG2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GmipQ6PGG2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GmipQ6PGG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GmipQ6PGG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GmipQ6PGG2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GmipQ6PGG2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GmipQ6PGG2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GmipQ6PGG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GmipQ6PGG2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GmipQ6PGG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
GmipQ6PGG2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GmipQ6PGG2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GmipQ6PGG2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms