Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CtifQ6PEE2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CtifQ6PEE2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CtifQ6PEE2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CtifQ6PEE2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CtifQ6PEE2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CtifQ6PEE2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CtifQ6PEE2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CtifQ6PEE2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CtifQ6PEE2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CtifQ6PEE2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CtifQ6PEE2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CtifQ6PEE2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CtifQ6PEE2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CtifQ6PEE2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CtifQ6PEE2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CtifQ6PEE2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CtifQ6PEE2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CtifQ6PEE2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CtifQ6PEE2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CtifQ6PEE2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CtifQ6PEE2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CtifQ6PEE2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CtifQ6PEE2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CtifQ6PEE2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CtifQ6PEE2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CtifQ6PEE2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CtifQ6PEE2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CtifQ6PEE2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CtifQ6PEE2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CtifQ6PEE2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CtifQ6PEE2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CtifQ6PEE2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CtifQ6PEE2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CtifQ6PEE2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CtifQ6PEE2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CtifQ6PEE2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CtifQ6PEE2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CtifQ6PEE2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CtifQ6PEE2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CtifQ6PEE2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CtifQ6PEE2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CtifQ6PEE2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CtifQ6PEE2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CtifQ6PEE2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CtifQ6PEE2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CtifQ6PEE2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CtifQ6PEE2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CtifQ6PEE2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CtifQ6PEE2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CtifQ6PEE2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CtifQ6PEE2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CtifQ6PEE2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CtifQ6PEE2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CtifQ6PEE2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CtifQ6PEE2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CtifQ6PEE2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CtifQ6PEE2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CtifQ6PEE2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CtifQ6PEE2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CtifQ6PEE2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CtifQ6PEE2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CtifQ6PEE2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CtifQ6PEE2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CtifQ6PEE2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CtifQ6PEE2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CtifQ6PEE2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CtifQ6PEE2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CtifQ6PEE2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CtifQ6PEE2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CtifQ6PEE2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CtifQ6PEE2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CtifQ6PEE2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CtifQ6PEE2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CtifQ6PEE2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CtifQ6PEE2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CtifQ6PEE2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CtifQ6PEE2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CtifQ6PEE2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CtifQ6PEE2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CtifQ6PEE2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CtifQ6PEE2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CtifQ6PEE2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CtifQ6PEE2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CtifQ6PEE2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CtifQ6PEE2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CtifQ6PEE2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CtifQ6PEE2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CtifQ6PEE2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CtifQ6PEE2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CtifQ6PEE2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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