Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,02■■■■□ 3,52
Nsd3Q6P2L6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,95■■■■□ 3,51
Nsd3Q6P2L6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,93■■■■□ 3,5
Nsd3Q6P2L6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,93■■■■□ 3,5
Nsd3Q6P2L6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Nsd3Q6P2L6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,89■■■■□ 3,5
Nsd3Q6P2L6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Nsd3Q6P2L6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC36,87■■■■□ 3,49
Nsd3Q6P2L6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Nsd3Q6P2L6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,8■■■■□ 3,48
Nsd3Q6P2L6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Nsd3Q6P2L6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Nsd3Q6P2L6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Nsd3Q6P2L6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,67■■■■□ 3,46
Nsd3Q6P2L6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Nsd3Q6P2L6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Nsd3Q6P2L6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Nsd3Q6P2L6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36,6■■■■□ 3,45
Nsd3Q6P2L6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,57■■■■□ 3,44
Nsd3Q6P2L6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36,54■■■■□ 3,44
Nsd3Q6P2L6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Nsd3Q6P2L6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Nsd3Q6P2L6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36,5■■■■□ 3,43
Nsd3Q6P2L6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36,49■■■■□ 3,43
Nsd3Q6P2L6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Nsd3Q6P2L6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Nsd3Q6P2L6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Nsd3Q6P2L6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Nsd3Q6P2L6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Nsd3Q6P2L6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Nsd3Q6P2L6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Nsd3Q6P2L6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Nsd3Q6P2L6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36,26■■■■□ 3,39
Nsd3Q6P2L6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Nsd3Q6P2L6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Nsd3Q6P2L6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Nsd3Q6P2L6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Nsd3Q6P2L6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Nsd3Q6P2L6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36,08■■■■□ 3,37
Nsd3Q6P2L6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Nsd3Q6P2L6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Nsd3Q6P2L6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Nsd3Q6P2L6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Nsd3Q6P2L6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Nsd3Q6P2L6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Nsd3Q6P2L6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Nsd3Q6P2L6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,96■■■■□ 3,35
Nsd3Q6P2L6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Nsd3Q6P2L6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Nsd3Q6P2L6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Nsd3Q6P2L6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35,88■■■■□ 3,33
Nsd3Q6P2L6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Nsd3Q6P2L6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Nsd3Q6P2L6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Nsd3Q6P2L6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Nsd3Q6P2L6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Nsd3Q6P2L6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Nsd3Q6P2L6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Nsd3Q6P2L6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Nsd3Q6P2L6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Nsd3Q6P2L6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Nsd3Q6P2L6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Nsd3Q6P2L6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Nsd3Q6P2L6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Nsd3Q6P2L6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Nsd3Q6P2L6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Nsd3Q6P2L6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35,57■■■■□ 3,28
Nsd3Q6P2L6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Nsd3Q6P2L6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,51■■■■□ 3,28
Nsd3Q6P2L6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Nsd3Q6P2L6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Nsd3Q6P2L6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Nsd3Q6P2L6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Nsd3Q6P2L6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
Nsd3Q6P2L6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Nsd3Q6P2L6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35,4■■■■□ 3,26
Nsd3Q6P2L6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Nsd3Q6P2L6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Nsd3Q6P2L6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Nsd3Q6P2L6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Nsd3Q6P2L6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Nsd3Q6P2L6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Nsd3Q6P2L6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nsd3Q6P2L6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nsd3Q6P2L6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35,28■■■■□ 3,24
Nsd3Q6P2L6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Nsd3Q6P2L6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Nsd3Q6P2L6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Nsd3Q6P2L6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Nsd3Q6P2L6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Nsd3Q6P2L6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Nsd3Q6P2L6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,22
Nsd3Q6P2L6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Nsd3Q6P2L6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Nsd3Q6P2L6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Nsd3Q6P2L6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Nsd3Q6P2L6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Nsd3Q6P2L6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Nsd3Q6P2L6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Nsd3Q6P2L6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms