Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Paxip1Q6NZQ4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Paxip1Q6NZQ4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Paxip1Q6NZQ4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Paxip1Q6NZQ4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Paxip1Q6NZQ4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Paxip1Q6NZQ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Paxip1Q6NZQ4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Paxip1Q6NZQ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Paxip1Q6NZQ4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Paxip1Q6NZQ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Paxip1Q6NZQ4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Paxip1Q6NZQ4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Paxip1Q6NZQ4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Paxip1Q6NZQ4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Paxip1Q6NZQ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Paxip1Q6NZQ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Paxip1Q6NZQ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Paxip1Q6NZQ4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Paxip1Q6NZQ4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Paxip1Q6NZQ4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Paxip1Q6NZQ4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Paxip1Q6NZQ4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Paxip1Q6NZQ4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Paxip1Q6NZQ4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Paxip1Q6NZQ4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Paxip1Q6NZQ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Paxip1Q6NZQ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Paxip1Q6NZQ4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Paxip1Q6NZQ4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Paxip1Q6NZQ4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Paxip1Q6NZQ4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Paxip1Q6NZQ4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Paxip1Q6NZQ4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Paxip1Q6NZQ4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Paxip1Q6NZQ4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Paxip1Q6NZQ4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Paxip1Q6NZQ4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Paxip1Q6NZQ4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Paxip1Q6NZQ4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Paxip1Q6NZQ4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Paxip1Q6NZQ4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Paxip1Q6NZQ4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Paxip1Q6NZQ4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Paxip1Q6NZQ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Paxip1Q6NZQ4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Paxip1Q6NZQ4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Paxip1Q6NZQ4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Paxip1Q6NZQ4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Paxip1Q6NZQ4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Paxip1Q6NZQ4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Paxip1Q6NZQ4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Paxip1Q6NZQ4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Paxip1Q6NZQ4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Paxip1Q6NZQ4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Paxip1Q6NZQ4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Paxip1Q6NZQ4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Paxip1Q6NZQ4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Paxip1Q6NZQ4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Paxip1Q6NZQ4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Paxip1Q6NZQ4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Paxip1Q6NZQ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Paxip1Q6NZQ4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Paxip1Q6NZQ4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Paxip1Q6NZQ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Paxip1Q6NZQ4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Paxip1Q6NZQ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Paxip1Q6NZQ4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Paxip1Q6NZQ4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Paxip1Q6NZQ4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Paxip1Q6NZQ4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Paxip1Q6NZQ4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Paxip1Q6NZQ4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Paxip1Q6NZQ4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Paxip1Q6NZQ4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Paxip1Q6NZQ4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Paxip1Q6NZQ4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Paxip1Q6NZQ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Paxip1Q6NZQ4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Paxip1Q6NZQ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Paxip1Q6NZQ4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Paxip1Q6NZQ4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Paxip1Q6NZQ4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Paxip1Q6NZQ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Paxip1Q6NZQ4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Paxip1Q6NZQ4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Paxip1Q6NZQ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Paxip1Q6NZQ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Paxip1Q6NZQ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms