Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Nckap5lQ6GQX2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37,84■■■■□ 3,65
Nckap5lQ6GQX2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Nckap5lQ6GQX2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,79■■■■□ 3,64
Nckap5lQ6GQX2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37,78■■■■□ 3,64
Nckap5lQ6GQX2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,76■■■■□ 3,64
Nckap5lQ6GQX2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Nckap5lQ6GQX2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Nckap5lQ6GQX2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37,71■■■■□ 3,63
Nckap5lQ6GQX2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37,71■■■■□ 3,63
Nckap5lQ6GQX2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Nckap5lQ6GQX2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37,67■■■■□ 3,62
Nckap5lQ6GQX2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Nckap5lQ6GQX2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,58■■■■□ 3,61
Nckap5lQ6GQX2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Nckap5lQ6GQX2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Nckap5lQ6GQX2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Nckap5lQ6GQX2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,42■■■■□ 3,58
Nckap5lQ6GQX2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Nckap5lQ6GQX2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
Nckap5lQ6GQX2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Nckap5lQ6GQX2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Nckap5lQ6GQX2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,54
Nckap5lQ6GQX2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Nckap5lQ6GQX2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37,1■■■■□ 3,53
Nckap5lQ6GQX2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Nckap5lQ6GQX2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Nckap5lQ6GQX2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,51
Nckap5lQ6GQX2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Nckap5lQ6GQX2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Nckap5lQ6GQX2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Nckap5lQ6GQX2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Nckap5lQ6GQX2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Nckap5lQ6GQX2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Nckap5lQ6GQX2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Nckap5lQ6GQX2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Nckap5lQ6GQX2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Nckap5lQ6GQX2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Nckap5lQ6GQX2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Nckap5lQ6GQX2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Nckap5lQ6GQX2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Nckap5lQ6GQX2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36,82■■■■□ 3,48
Nckap5lQ6GQX2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Nckap5lQ6GQX2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Nckap5lQ6GQX2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36,79■■■■□ 3,48
Nckap5lQ6GQX2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36,79■■■■□ 3,48
Nckap5lQ6GQX2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Nckap5lQ6GQX2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Nckap5lQ6GQX2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Nckap5lQ6GQX2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Nckap5lQ6GQX2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Nckap5lQ6GQX2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36,58■■■■□ 3,45
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Nckap5lQ6GQX2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Nckap5lQ6GQX2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Nckap5lQ6GQX2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Nckap5lQ6GQX2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Nckap5lQ6GQX2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Nckap5lQ6GQX2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,51■■■■□ 3,43
Nckap5lQ6GQX2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Nckap5lQ6GQX2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Nckap5lQ6GQX2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Nckap5lQ6GQX2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Nckap5lQ6GQX2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Nckap5lQ6GQX2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36,34■■■■□ 3,41
Nckap5lQ6GQX2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Nckap5lQ6GQX2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36,31■■■■□ 3,4
Nckap5lQ6GQX2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Nckap5lQ6GQX2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Nckap5lQ6GQX2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Nckap5lQ6GQX2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Nckap5lQ6GQX2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Nckap5lQ6GQX2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Nckap5lQ6GQX2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Nckap5lQ6GQX2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,14■■■■□ 3,38
Nckap5lQ6GQX2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Nckap5lQ6GQX2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Nckap5lQ6GQX2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36,08■■■■□ 3,37
Nckap5lQ6GQX2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Nckap5lQ6GQX2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Nckap5lQ6GQX2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36,01■■■■□ 3,36
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Nckap5lQ6GQX2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Nckap5lQ6GQX2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Nckap5lQ6GQX2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Nckap5lQ6GQX2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Nckap5lQ6GQX2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Nckap5lQ6GQX2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Nckap5lQ6GQX2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Nckap5lQ6GQX2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Nckap5lQ6GQX2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Nckap5lQ6GQX2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Nckap5lQ6GQX2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35,85■■■■□ 3,33
Nckap5lQ6GQX2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Nckap5lQ6GQX2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Nckap5lQ6GQX2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Nckap5lQ6GQX2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Nckap5lQ6GQX2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Nckap5lQ6GQX2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC35,77■■■■□ 3,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms