Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Gbf1Q6DFZ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Gbf1Q6DFZ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Gbf1Q6DFZ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Gbf1Q6DFZ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Gbf1Q6DFZ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gbf1Q6DFZ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gbf1Q6DFZ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gbf1Q6DFZ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Gbf1Q6DFZ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Gbf1Q6DFZ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Gbf1Q6DFZ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gbf1Q6DFZ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Gbf1Q6DFZ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gbf1Q6DFZ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gbf1Q6DFZ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Gbf1Q6DFZ1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Gbf1Q6DFZ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Gbf1Q6DFZ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gbf1Q6DFZ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gbf1Q6DFZ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
Gbf1Q6DFZ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gbf1Q6DFZ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Gbf1Q6DFZ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Gbf1Q6DFZ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gbf1Q6DFZ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gbf1Q6DFZ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Gbf1Q6DFZ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Gbf1Q6DFZ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Gbf1Q6DFZ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Gbf1Q6DFZ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Gbf1Q6DFZ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Gbf1Q6DFZ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Gbf1Q6DFZ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,83■■■□□ 2,2
Gbf1Q6DFZ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Gbf1Q6DFZ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Gbf1Q6DFZ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Gbf1Q6DFZ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Gbf1Q6DFZ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Gbf1Q6DFZ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Gbf1Q6DFZ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Gbf1Q6DFZ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Gbf1Q6DFZ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Gbf1Q6DFZ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Gbf1Q6DFZ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Gbf1Q6DFZ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,61■■■□□ 2,17
Gbf1Q6DFZ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gbf1Q6DFZ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Gbf1Q6DFZ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Gbf1Q6DFZ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Gbf1Q6DFZ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Gbf1Q6DFZ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gbf1Q6DFZ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gbf1Q6DFZ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Gbf1Q6DFZ1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Gbf1Q6DFZ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gbf1Q6DFZ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gbf1Q6DFZ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Gbf1Q6DFZ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Gbf1Q6DFZ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gbf1Q6DFZ1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gbf1Q6DFZ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gbf1Q6DFZ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Gbf1Q6DFZ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Gbf1Q6DFZ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gbf1Q6DFZ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Gbf1Q6DFZ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gbf1Q6DFZ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Gbf1Q6DFZ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Gbf1Q6DFZ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Gbf1Q6DFZ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gbf1Q6DFZ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gbf1Q6DFZ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gbf1Q6DFZ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gbf1Q6DFZ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Gbf1Q6DFZ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gbf1Q6DFZ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Gbf1Q6DFZ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gbf1Q6DFZ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gbf1Q6DFZ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Gbf1Q6DFZ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gbf1Q6DFZ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gbf1Q6DFZ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Gbf1Q6DFZ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Gbf1Q6DFZ1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Gbf1Q6DFZ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Gbf1Q6DFZ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Gbf1Q6DFZ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Gbf1Q6DFZ1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Gbf1Q6DFZ1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gbf1Q6DFZ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gbf1Q6DFZ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Gbf1Q6DFZ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Gbf1Q6DFZ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Gbf1Q6DFZ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Gbf1Q6DFZ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Gbf1Q6DFZ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
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