Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab3ipQ68EF0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab3ipQ68EF0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rab3ipQ68EF0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab3ipQ68EF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rab3ipQ68EF0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3ipQ68EF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3ipQ68EF0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab3ipQ68EF0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3ipQ68EF0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3ipQ68EF0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3ipQ68EF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3ipQ68EF0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3ipQ68EF0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3ipQ68EF0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3ipQ68EF0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3ipQ68EF0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3ipQ68EF0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3ipQ68EF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3ipQ68EF0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3ipQ68EF0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3ipQ68EF0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3ipQ68EF0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3ipQ68EF0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3ipQ68EF0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3ipQ68EF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab3ipQ68EF0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab3ipQ68EF0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab3ipQ68EF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab3ipQ68EF0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab3ipQ68EF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3ipQ68EF0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab3ipQ68EF0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab3ipQ68EF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3ipQ68EF0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab3ipQ68EF0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab3ipQ68EF0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3ipQ68EF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab3ipQ68EF0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab3ipQ68EF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab3ipQ68EF0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab3ipQ68EF0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab3ipQ68EF0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab3ipQ68EF0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab3ipQ68EF0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab3ipQ68EF0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab3ipQ68EF0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab3ipQ68EF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab3ipQ68EF0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab3ipQ68EF0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab3ipQ68EF0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab3ipQ68EF0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab3ipQ68EF0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab3ipQ68EF0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab3ipQ68EF0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab3ipQ68EF0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rab3ipQ68EF0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3ipQ68EF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3ipQ68EF0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3ipQ68EF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3ipQ68EF0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3ipQ68EF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3ipQ68EF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab3ipQ68EF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab3ipQ68EF0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3ipQ68EF0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3ipQ68EF0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3ipQ68EF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3ipQ68EF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab3ipQ68EF0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab3ipQ68EF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab3ipQ68EF0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab3ipQ68EF0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rab3ipQ68EF0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab3ipQ68EF0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3ipQ68EF0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3ipQ68EF0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3ipQ68EF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3ipQ68EF0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3ipQ68EF0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3ipQ68EF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3ipQ68EF0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3ipQ68EF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3ipQ68EF0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3ipQ68EF0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3ipQ68EF0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3ipQ68EF0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3ipQ68EF0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3ipQ68EF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3ipQ68EF0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3ipQ68EF0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3ipQ68EF0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3ipQ68EF0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3ipQ68EF0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3ipQ68EF0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab3ipQ68EF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab3ipQ68EF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms