Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV4

Rbm12b2, RNA-binding protein 12B-B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm12b2Q66JV4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Rbm12b2Q66JV4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Rbm12b2Q66JV4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Rbm12b2Q66JV4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Rbm12b2Q66JV4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Rbm12b2Q66JV4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Rbm12b2Q66JV4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,61■■■□□ 2,49
Rbm12b2Q66JV4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Rbm12b2Q66JV4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Rbm12b2Q66JV4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Rbm12b2Q66JV4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Rbm12b2Q66JV4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Rbm12b2Q66JV4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Rbm12b2Q66JV4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Rbm12b2Q66JV4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Rbm12b2Q66JV4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Rbm12b2Q66JV4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Rbm12b2Q66JV4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Rbm12b2Q66JV4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Rbm12b2Q66JV4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Rbm12b2Q66JV4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Rbm12b2Q66JV4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Rbm12b2Q66JV4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Rbm12b2Q66JV4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Rbm12b2Q66JV4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Rbm12b2Q66JV4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Rbm12b2Q66JV4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Rbm12b2Q66JV4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Rbm12b2Q66JV4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Rbm12b2Q66JV4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Rbm12b2Q66JV4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Rbm12b2Q66JV4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Rbm12b2Q66JV4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Rbm12b2Q66JV4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Rbm12b2Q66JV4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Rbm12b2Q66JV4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Rbm12b2Q66JV4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Rbm12b2Q66JV4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Rbm12b2Q66JV4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Rbm12b2Q66JV4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Rbm12b2Q66JV4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Rbm12b2Q66JV4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Rbm12b2Q66JV4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Rbm12b2Q66JV4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Rbm12b2Q66JV4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Rbm12b2Q66JV4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Rbm12b2Q66JV4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Rbm12b2Q66JV4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Rbm12b2Q66JV4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Rbm12b2Q66JV4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rbm12b2Q66JV4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rbm12b2Q66JV4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Rbm12b2Q66JV4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Rbm12b2Q66JV4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rbm12b2Q66JV4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Rbm12b2Q66JV4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Rbm12b2Q66JV4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Rbm12b2Q66JV4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rbm12b2Q66JV4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rbm12b2Q66JV4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rbm12b2Q66JV4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Rbm12b2Q66JV4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Rbm12b2Q66JV4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Rbm12b2Q66JV4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Rbm12b2Q66JV4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Rbm12b2Q66JV4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Rbm12b2Q66JV4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Rbm12b2Q66JV4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Rbm12b2Q66JV4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Rbm12b2Q66JV4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Rbm12b2Q66JV4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Rbm12b2Q66JV4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Rbm12b2Q66JV4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Rbm12b2Q66JV4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rbm12b2Q66JV4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Rbm12b2Q66JV4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Rbm12b2Q66JV4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Rbm12b2Q66JV4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Rbm12b2Q66JV4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Rbm12b2Q66JV4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Rbm12b2Q66JV4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Rbm12b2Q66JV4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Rbm12b2Q66JV4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Rbm12b2Q66JV4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Rbm12b2Q66JV4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Rbm12b2Q66JV4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rbm12b2Q66JV4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Rbm12b2Q66JV4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Rbm12b2Q66JV4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Rbm12b2Q66JV4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,9 ms