Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ptpn13Q64512 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ptpn13Q64512 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ptpn13Q64512 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ptpn13Q64512 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ptpn13Q64512 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ptpn13Q64512 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ptpn13Q64512 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ptpn13Q64512 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ptpn13Q64512 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ptpn13Q64512 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ptpn13Q64512 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ptpn13Q64512 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
Ptpn13Q64512 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ptpn13Q64512 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ptpn13Q64512 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ptpn13Q64512 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Ptpn13Q64512 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ptpn13Q64512 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ptpn13Q64512 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ptpn13Q64512 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ptpn13Q64512 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ptpn13Q64512 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ptpn13Q64512 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ptpn13Q64512 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ptpn13Q64512 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ptpn13Q64512 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Ptpn13Q64512 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ptpn13Q64512 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ptpn13Q64512 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ptpn13Q64512 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Ptpn13Q64512 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ptpn13Q64512 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Ptpn13Q64512 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ptpn13Q64512 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ptpn13Q64512 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,59
Ptpn13Q64512 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Ptpn13Q64512 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Ptpn13Q64512 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ptpn13Q64512 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ptpn13Q64512 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ptpn13Q64512 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Ptpn13Q64512 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ptpn13Q64512 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Ptpn13Q64512 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
Ptpn13Q64512 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Ptpn13Q64512 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Ptpn13Q64512 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ptpn13Q64512 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ptpn13Q64512 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ptpn13Q64512 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ptpn13Q64512 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ptpn13Q64512 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Ptpn13Q64512 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Ptpn13Q64512 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Ptpn13Q64512 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ptpn13Q64512 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Ptpn13Q64512 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Ptpn13Q64512 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Ptpn13Q64512 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Ptpn13Q64512 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ptpn13Q64512 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ptpn13Q64512 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ptpn13Q64512 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ptpn13Q64512 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Ptpn13Q64512 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
Ptpn13Q64512 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Ptpn13Q64512 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Ptpn13Q64512 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Ptpn13Q64512 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ptpn13Q64512 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Ptpn13Q64512 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Ptpn13Q64512 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ptpn13Q64512 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Ptpn13Q64512 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Ptpn13Q64512 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
Ptpn13Q64512 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Ptpn13Q64512 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Ptpn13Q64512 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Ptpn13Q64512 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Ptpn13Q64512 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Ptpn13Q64512 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ptpn13Q64512 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Ptpn13Q64512 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24,33■■□□□ 1,48
Ptpn13Q64512 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ptpn13Q64512 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ptpn13Q64512 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ptpn13Q64512 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Ptpn13Q64512 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
Ptpn13Q64512 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ptpn13Q64512 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
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