Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gja3Q64448 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gja3Q64448 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gja3Q64448 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gja3Q64448 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gja3Q64448 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Gja3Q64448 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Gja3Q64448 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Gja3Q64448 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gja3Q64448 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Gja3Q64448 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Gja3Q64448 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Gja3Q64448 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Gja3Q64448 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gja3Q64448 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Gja3Q64448 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gja3Q64448 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gja3Q64448 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gja3Q64448 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gja3Q64448 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gja3Q64448 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gja3Q64448 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gja3Q64448 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gja3Q64448 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Gja3Q64448 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gja3Q64448 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gja3Q64448 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Gja3Q64448 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gja3Q64448 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gja3Q64448 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gja3Q64448 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Gja3Q64448 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Gja3Q64448 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gja3Q64448 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Gja3Q64448 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Gja3Q64448 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Gja3Q64448 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gja3Q64448 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gja3Q64448 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gja3Q64448 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Gja3Q64448 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Gja3Q64448 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Gja3Q64448 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Gja3Q64448 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Gja3Q64448 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Gja3Q64448 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Gja3Q64448 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gja3Q64448 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Gja3Q64448 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gja3Q64448 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gja3Q64448 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Gja3Q64448 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gja3Q64448 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gja3Q64448 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gja3Q64448 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gja3Q64448 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gja3Q64448 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gja3Q64448 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gja3Q64448 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gja3Q64448 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gja3Q64448 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gja3Q64448 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Gja3Q64448 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gja3Q64448 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gja3Q64448 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gja3Q64448 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gja3Q64448 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gja3Q64448 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gja3Q64448 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gja3Q64448 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gja3Q64448 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gja3Q64448 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gja3Q64448 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gja3Q64448 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Gja3Q64448 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gja3Q64448 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gja3Q64448 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gja3Q64448 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gja3Q64448 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gja3Q64448 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gja3Q64448 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gja3Q64448 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gja3Q64448 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Gja3Q64448 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Gja3Q64448 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gja3Q64448 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gja3Q64448 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gja3Q64448 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gja3Q64448 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gja3Q64448 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gja3Q64448 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gja3Q64448 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gja3Q64448 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gja3Q64448 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gja3Q64448 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gja3Q64448 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gja3Q64448 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gja3Q64448 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gja3Q64448 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gja3Q64448 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms