Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Atp7bQ64446 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Atp7bQ64446 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Atp7bQ64446 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,41■■■■□ 3,74
Atp7bQ64446 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Atp7bQ64446 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Atp7bQ64446 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38,28■■■■□ 3,72
Atp7bQ64446 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Atp7bQ64446 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Atp7bQ64446 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38,22■■■■□ 3,71
Atp7bQ64446 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,15■■■■□ 3,7
Atp7bQ64446 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Atp7bQ64446 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Atp7bQ64446 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Atp7bQ64446 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
Atp7bQ64446 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,11■■■■□ 3,69
Atp7bQ64446 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
Atp7bQ64446 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38,04■■■■□ 3,68
Atp7bQ64446 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Atp7bQ64446 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Atp7bQ64446 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Atp7bQ64446 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Atp7bQ64446 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Atp7bQ64446 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Atp7bQ64446 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Atp7bQ64446 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Atp7bQ64446 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Atp7bQ64446 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC37,79■■■■□ 3,64
Atp7bQ64446 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37,77■■■■□ 3,64
Atp7bQ64446 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Atp7bQ64446 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37,75■■■■□ 3,63
Atp7bQ64446 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Atp7bQ64446 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37,67■■■■□ 3,62
Atp7bQ64446 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Atp7bQ64446 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Atp7bQ64446 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37,63■■■■□ 3,61
Atp7bQ64446 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Atp7bQ64446 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37,62■■■■□ 3,61
Atp7bQ64446 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Atp7bQ64446 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Atp7bQ64446 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Atp7bQ64446 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Atp7bQ64446 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Atp7bQ64446 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,51■■■■□ 3,59
Atp7bQ64446 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37,51■■■■□ 3,59
Atp7bQ64446 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Atp7bQ64446 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Atp7bQ64446 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37,37■■■■□ 3,57
Atp7bQ64446 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Atp7bQ64446 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,32■■■■□ 3,56
Atp7bQ64446 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Atp7bQ64446 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Atp7bQ64446 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Atp7bQ64446 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37,29■■■■□ 3,56
Atp7bQ64446 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Atp7bQ64446 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Atp7bQ64446 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Atp7bQ64446 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Atp7bQ64446 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37,12■■■■□ 3,53
Atp7bQ64446 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,12■■■■□ 3,53
Atp7bQ64446 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Atp7bQ64446 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Atp7bQ64446 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC37,07■■■■□ 3,52
Atp7bQ64446 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Atp7bQ64446 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37,05■■■■□ 3,52
Atp7bQ64446 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Atp7bQ64446 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37,01■■■■□ 3,51
Atp7bQ64446 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Atp7bQ64446 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Atp7bQ64446 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Atp7bQ64446 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Atp7bQ64446 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Atp7bQ64446 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Atp7bQ64446 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36,93■■■■□ 3,5
Atp7bQ64446 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Atp7bQ64446 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Atp7bQ64446 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Atp7bQ64446 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,8■■■■□ 3,48
Atp7bQ64446 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36,8■■■■□ 3,48
Atp7bQ64446 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Atp7bQ64446 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Atp7bQ64446 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,73■■■■□ 3,47
Atp7bQ64446 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36,67■■■■□ 3,46
Atp7bQ64446 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36,67■■■■□ 3,46
Atp7bQ64446 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Atp7bQ64446 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36,65■■■■□ 3,46
Atp7bQ64446 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Atp7bQ64446 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Atp7bQ64446 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Atp7bQ64446 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Atp7bQ64446 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Atp7bQ64446 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36,58■■■■□ 3,45
Atp7bQ64446 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36,58■■■■□ 3,45
Atp7bQ64446 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Atp7bQ64446 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Atp7bQ64446 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36,55■■■■□ 3,44
Atp7bQ64446 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36,52■■■■□ 3,44
Atp7bQ64446 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Atp7bQ64446 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Atp7bQ64446 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms