Protein–RNA interactions for Protein: Q64151

Sema4c, Semaphorin-4C, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4cQ64151 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema4cQ64151 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema4cQ64151 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema4cQ64151 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sema4cQ64151 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema4cQ64151 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema4cQ64151 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sema4cQ64151 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sema4cQ64151 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema4cQ64151 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema4cQ64151 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema4cQ64151 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema4cQ64151 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema4cQ64151 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sema4cQ64151 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sema4cQ64151 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sema4cQ64151 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sema4cQ64151 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sema4cQ64151 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sema4cQ64151 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sema4cQ64151 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema4cQ64151 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema4cQ64151 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema4cQ64151 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema4cQ64151 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema4cQ64151 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema4cQ64151 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema4cQ64151 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema4cQ64151 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema4cQ64151 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema4cQ64151 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema4cQ64151 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema4cQ64151 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema4cQ64151 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema4cQ64151 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema4cQ64151 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema4cQ64151 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema4cQ64151 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema4cQ64151 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema4cQ64151 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema4cQ64151 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sema4cQ64151 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema4cQ64151 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sema4cQ64151 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema4cQ64151 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema4cQ64151 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema4cQ64151 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sema4cQ64151 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema4cQ64151 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sema4cQ64151 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sema4cQ64151 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema4cQ64151 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema4cQ64151 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema4cQ64151 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sema4cQ64151 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sema4cQ64151 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sema4cQ64151 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sema4cQ64151 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sema4cQ64151 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema4cQ64151 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema4cQ64151 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema4cQ64151 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sema4cQ64151 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sema4cQ64151 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema4cQ64151 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sema4cQ64151 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema4cQ64151 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema4cQ64151 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema4cQ64151 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sema4cQ64151 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sema4cQ64151 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sema4cQ64151 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema4cQ64151 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema4cQ64151 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema4cQ64151 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema4cQ64151 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema4cQ64151 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema4cQ64151 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4cQ64151 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sema4cQ64151 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema4cQ64151 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sema4cQ64151 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema4cQ64151 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema4cQ64151 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema4cQ64151 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema4cQ64151 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema4cQ64151 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema4cQ64151 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema4cQ64151 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema4cQ64151 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema4cQ64151 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms