Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Aebp1Q640N1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
Aebp1Q640N1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
Aebp1Q640N1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Aebp1Q640N1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Aebp1Q640N1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Aebp1Q640N1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Aebp1Q640N1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
Aebp1Q640N1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Aebp1Q640N1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
Aebp1Q640N1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Aebp1Q640N1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC44■■■■■ 4.63
Aebp1Q640N1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
Aebp1Q640N1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Aebp1Q640N1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Aebp1Q640N1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Aebp1Q640N1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Aebp1Q640N1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Aebp1Q640N1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Aebp1Q640N1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Aebp1Q640N1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Aebp1Q640N1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Aebp1Q640N1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Aebp1Q640N1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Aebp1Q640N1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Aebp1Q640N1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Aebp1Q640N1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
Aebp1Q640N1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Aebp1Q640N1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
Aebp1Q640N1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Aebp1Q640N1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
Aebp1Q640N1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Aebp1Q640N1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Aebp1Q640N1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Aebp1Q640N1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Aebp1Q640N1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Aebp1Q640N1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
Aebp1Q640N1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Aebp1Q640N1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Aebp1Q640N1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Aebp1Q640N1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Aebp1Q640N1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Aebp1Q640N1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Aebp1Q640N1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Aebp1Q640N1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
Aebp1Q640N1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Aebp1Q640N1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Aebp1Q640N1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Aebp1Q640N1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Aebp1Q640N1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.82■■■■■ 4.45
Aebp1Q640N1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Aebp1Q640N1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Aebp1Q640N1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Aebp1Q640N1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Aebp1Q640N1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
Aebp1Q640N1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Aebp1Q640N1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Aebp1Q640N1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Aebp1Q640N1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Aebp1Q640N1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Aebp1Q640N1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Aebp1Q640N1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
Aebp1Q640N1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Aebp1Q640N1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Aebp1Q640N1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Aebp1Q640N1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Aebp1Q640N1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Aebp1Q640N1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Aebp1Q640N1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Aebp1Q640N1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
Aebp1Q640N1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Aebp1Q640N1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Aebp1Q640N1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Aebp1Q640N1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Aebp1Q640N1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Aebp1Q640N1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Aebp1Q640N1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
Aebp1Q640N1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Aebp1Q640N1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Aebp1Q640N1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Aebp1Q640N1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Aebp1Q640N1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
Aebp1Q640N1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Aebp1Q640N1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Aebp1Q640N1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Aebp1Q640N1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Aebp1Q640N1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Aebp1Q640N1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Aebp1Q640N1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Aebp1Q640N1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Aebp1Q640N1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Aebp1Q640N1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Aebp1Q640N1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Aebp1Q640N1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Aebp1Q640N1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Aebp1Q640N1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Aebp1Q640N1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Aebp1Q640N1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Aebp1Q640N1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Aebp1Q640N1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms