Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
Ccdc18Q640L5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Ccdc18Q640L5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Ccdc18Q640L5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Ccdc18Q640L5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Ccdc18Q640L5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
Ccdc18Q640L5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Ccdc18Q640L5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
Ccdc18Q640L5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
Ccdc18Q640L5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
Ccdc18Q640L5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
Ccdc18Q640L5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.15
Ccdc18Q640L5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
Ccdc18Q640L5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Ccdc18Q640L5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Ccdc18Q640L5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC46.98■■■■■ 5.11
Ccdc18Q640L5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Ccdc18Q640L5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
Ccdc18Q640L5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Ccdc18Q640L5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Ccdc18Q640L5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
Ccdc18Q640L5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
Ccdc18Q640L5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Ccdc18Q640L5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC46.76■■■■■ 5.08
Ccdc18Q640L5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC46.75■■■■■ 5.07
Ccdc18Q640L5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Ccdc18Q640L5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
Ccdc18Q640L5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Ccdc18Q640L5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Ccdc18Q640L5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC46.63■■■■■ 5.06
Ccdc18Q640L5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
Ccdc18Q640L5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
Ccdc18Q640L5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Ccdc18Q640L5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
Ccdc18Q640L5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
Ccdc18Q640L5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC46.49■■■■■ 5.03
Ccdc18Q640L5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.03
Ccdc18Q640L5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
Ccdc18Q640L5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
Ccdc18Q640L5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
Ccdc18Q640L5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Ccdc18Q640L5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
Ccdc18Q640L5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
Ccdc18Q640L5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Ccdc18Q640L5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Ccdc18Q640L5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Ccdc18Q640L5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC46.27■■■■■ 5
Ccdc18Q640L5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC46.25■■■■■ 5
Ccdc18Q640L5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Ccdc18Q640L5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Ccdc18Q640L5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Ccdc18Q640L5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
Ccdc18Q640L5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
Ccdc18Q640L5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Ccdc18Q640L5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Ccdc18Q640L5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC46.07■■■■■ 4.96
Ccdc18Q640L5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.96
Ccdc18Q640L5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Ccdc18Q640L5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Ccdc18Q640L5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
Ccdc18Q640L5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Ccdc18Q640L5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC45.94■■■■■ 4.94
Ccdc18Q640L5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
Ccdc18Q640L5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Ccdc18Q640L5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
Ccdc18Q640L5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
Ccdc18Q640L5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
Ccdc18Q640L5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Ccdc18Q640L5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
Ccdc18Q640L5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Ccdc18Q640L5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
Ccdc18Q640L5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Ccdc18Q640L5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
Ccdc18Q640L5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Ccdc18Q640L5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC45.49■■■■■ 4.87
Ccdc18Q640L5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
Ccdc18Q640L5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
Ccdc18Q640L5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
Ccdc18Q640L5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Ccdc18Q640L5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC45.42■■■■■ 4.86
Ccdc18Q640L5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
Ccdc18Q640L5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
Ccdc18Q640L5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
Ccdc18Q640L5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
Ccdc18Q640L5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
Ccdc18Q640L5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Ccdc18Q640L5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Ccdc18Q640L5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Ccdc18Q640L5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Ccdc18Q640L5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Ccdc18Q640L5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC45.3■■■■■ 4.84
Ccdc18Q640L5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Ccdc18Q640L5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
Ccdc18Q640L5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Ccdc18Q640L5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
Ccdc18Q640L5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
Ccdc18Q640L5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Ccdc18Q640L5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Ccdc18Q640L5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Ccdc18Q640L5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
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