Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp1Q62442 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp1Q62442 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp1Q62442 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp1Q62442 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp1Q62442 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp1Q62442 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vamp1Q62442 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp1Q62442 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp1Q62442 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp1Q62442 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vamp1Q62442 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vamp1Q62442 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vamp1Q62442 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vamp1Q62442 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vamp1Q62442 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vamp1Q62442 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp1Q62442 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp1Q62442 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vamp1Q62442 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vamp1Q62442 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vamp1Q62442 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vamp1Q62442 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vamp1Q62442 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vamp1Q62442 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp1Q62442 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp1Q62442 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp1Q62442 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vamp1Q62442 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vamp1Q62442 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp1Q62442 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vamp1Q62442 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Vamp1Q62442 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vamp1Q62442 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vamp1Q62442 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp1Q62442 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vamp1Q62442 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp1Q62442 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vamp1Q62442 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vamp1Q62442 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp1Q62442 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vamp1Q62442 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vamp1Q62442 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp1Q62442 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vamp1Q62442 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vamp1Q62442 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vamp1Q62442 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vamp1Q62442 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vamp1Q62442 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vamp1Q62442 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp1Q62442 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp1Q62442 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vamp1Q62442 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vamp1Q62442 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp1Q62442 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vamp1Q62442 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vamp1Q62442 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp1Q62442 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp1Q62442 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vamp1Q62442 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp1Q62442 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vamp1Q62442 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vamp1Q62442 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp1Q62442 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp1Q62442 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp1Q62442 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp1Q62442 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp1Q62442 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp1Q62442 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp1Q62442 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp1Q62442 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp1Q62442 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp1Q62442 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vamp1Q62442 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp1Q62442 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp1Q62442 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vamp1Q62442 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp1Q62442 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vamp1Q62442 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms