Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sema5aQ62217 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sema5aQ62217 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sema5aQ62217 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sema5aQ62217 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sema5aQ62217 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sema5aQ62217 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sema5aQ62217 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Sema5aQ62217 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sema5aQ62217 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sema5aQ62217 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema5aQ62217 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sema5aQ62217 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sema5aQ62217 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema5aQ62217 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sema5aQ62217 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sema5aQ62217 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sema5aQ62217 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sema5aQ62217 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sema5aQ62217 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sema5aQ62217 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Sema5aQ62217 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sema5aQ62217 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sema5aQ62217 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sema5aQ62217 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sema5aQ62217 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sema5aQ62217 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sema5aQ62217 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sema5aQ62217 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sema5aQ62217 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema5aQ62217 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema5aQ62217 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sema5aQ62217 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Sema5aQ62217 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Sema5aQ62217 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sema5aQ62217 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sema5aQ62217 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sema5aQ62217 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sema5aQ62217 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sema5aQ62217 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema5aQ62217 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema5aQ62217 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema5aQ62217 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema5aQ62217 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema5aQ62217 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sema5aQ62217 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema5aQ62217 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema5aQ62217 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema5aQ62217 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sema5aQ62217 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema5aQ62217 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema5aQ62217 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sema5aQ62217 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sema5aQ62217 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema5aQ62217 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema5aQ62217 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sema5aQ62217 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema5aQ62217 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema5aQ62217 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sema5aQ62217 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema5aQ62217 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema5aQ62217 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sema5aQ62217 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Sema5aQ62217 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sema5aQ62217 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema5aQ62217 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema5aQ62217 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema5aQ62217 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema5aQ62217 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema5aQ62217 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sema5aQ62217 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sema5aQ62217 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sema5aQ62217 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sema5aQ62217 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Sema5aQ62217 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sema5aQ62217 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema5aQ62217 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema5aQ62217 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sema5aQ62217 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema5aQ62217 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sema5aQ62217 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sema5aQ62217 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sema5aQ62217 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema5aQ62217 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema5aQ62217 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Sema5aQ62217 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sema5aQ62217 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sema5aQ62217 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema5aQ62217 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema5aQ62217 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sema5aQ62217 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema5aQ62217 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sema5aQ62217 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema5aQ62217 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema5aQ62217 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema5aQ62217 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema5aQ62217 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema5aQ62217 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema5aQ62217 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema5aQ62217 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms