Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sema4aQ62178 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema4aQ62178 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sema4aQ62178 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Sema4aQ62178 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema4aQ62178 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema4aQ62178 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema4aQ62178 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema4aQ62178 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema4aQ62178 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema4aQ62178 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema4aQ62178 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema4aQ62178 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema4aQ62178 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema4aQ62178 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema4aQ62178 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sema4aQ62178 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema4aQ62178 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sema4aQ62178 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema4aQ62178 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema4aQ62178 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema4aQ62178 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sema4aQ62178 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sema4aQ62178 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema4aQ62178 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sema4aQ62178 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema4aQ62178 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema4aQ62178 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sema4aQ62178 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema4aQ62178 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sema4aQ62178 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sema4aQ62178 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sema4aQ62178 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sema4aQ62178 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sema4aQ62178 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sema4aQ62178 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema4aQ62178 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sema4aQ62178 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema4aQ62178 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema4aQ62178 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sema4aQ62178 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sema4aQ62178 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sema4aQ62178 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema4aQ62178 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema4aQ62178 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema4aQ62178 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema4aQ62178 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema4aQ62178 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema4aQ62178 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sema4aQ62178 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema4aQ62178 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema4aQ62178 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sema4aQ62178 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema4aQ62178 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sema4aQ62178 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sema4aQ62178 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema4aQ62178 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema4aQ62178 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sema4aQ62178 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sema4aQ62178 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sema4aQ62178 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sema4aQ62178 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sema4aQ62178 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sema4aQ62178 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sema4aQ62178 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema4aQ62178 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sema4aQ62178 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sema4aQ62178 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema4aQ62178 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema4aQ62178 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sema4aQ62178 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema4aQ62178 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sema4aQ62178 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sema4aQ62178 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema4aQ62178 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema4aQ62178 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema4aQ62178 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema4aQ62178 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema4aQ62178 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema4aQ62178 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema4aQ62178 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema4aQ62178 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sema4aQ62178 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema4aQ62178 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema4aQ62178 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema4aQ62178 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sema4aQ62178 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4aQ62178 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4aQ62178 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema4aQ62178 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms