Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MslnQ61468 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MslnQ61468 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MslnQ61468 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MslnQ61468 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MslnQ61468 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MslnQ61468 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MslnQ61468 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MslnQ61468 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MslnQ61468 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MslnQ61468 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MslnQ61468 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MslnQ61468 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MslnQ61468 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MslnQ61468 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MslnQ61468 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MslnQ61468 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MslnQ61468 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MslnQ61468 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MslnQ61468 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MslnQ61468 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MslnQ61468 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MslnQ61468 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MslnQ61468 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MslnQ61468 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MslnQ61468 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MslnQ61468 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MslnQ61468 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MslnQ61468 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MslnQ61468 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MslnQ61468 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MslnQ61468 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MslnQ61468 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MslnQ61468 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MslnQ61468 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MslnQ61468 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MslnQ61468 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MslnQ61468 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MslnQ61468 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MslnQ61468 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MslnQ61468 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MslnQ61468 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MslnQ61468 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MslnQ61468 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MslnQ61468 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MslnQ61468 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MslnQ61468 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MslnQ61468 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MslnQ61468 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MslnQ61468 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MslnQ61468 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MslnQ61468 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MslnQ61468 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MslnQ61468 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MslnQ61468 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MslnQ61468 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MslnQ61468 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MslnQ61468 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MslnQ61468 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MslnQ61468 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MslnQ61468 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MslnQ61468 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MslnQ61468 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MslnQ61468 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MslnQ61468 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MslnQ61468 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MslnQ61468 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MslnQ61468 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MslnQ61468 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MslnQ61468 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MslnQ61468 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MslnQ61468 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MslnQ61468 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MslnQ61468 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MslnQ61468 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MslnQ61468 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MslnQ61468 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MslnQ61468 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MslnQ61468 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MslnQ61468 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MslnQ61468 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MslnQ61468 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MslnQ61468 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MslnQ61468 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MslnQ61468 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MslnQ61468 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MslnQ61468 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MslnQ61468 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MslnQ61468 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MslnQ61468 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MslnQ61468 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MslnQ61468 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MslnQ61468 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MslnQ61468 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MslnQ61468 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MslnQ61468 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MslnQ61468 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MslnQ61468 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MslnQ61468 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MslnQ61468 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms