Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gata6Q61169 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gata6Q61169 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gata6Q61169 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gata6Q61169 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gata6Q61169 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gata6Q61169 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gata6Q61169 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gata6Q61169 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gata6Q61169 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gata6Q61169 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gata6Q61169 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gata6Q61169 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gata6Q61169 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gata6Q61169 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gata6Q61169 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gata6Q61169 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gata6Q61169 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gata6Q61169 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gata6Q61169 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gata6Q61169 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gata6Q61169 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gata6Q61169 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gata6Q61169 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gata6Q61169 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gata6Q61169 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gata6Q61169 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gata6Q61169 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gata6Q61169 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gata6Q61169 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gata6Q61169 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gata6Q61169 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gata6Q61169 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gata6Q61169 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gata6Q61169 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gata6Q61169 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gata6Q61169 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gata6Q61169 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gata6Q61169 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gata6Q61169 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gata6Q61169 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gata6Q61169 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gata6Q61169 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gata6Q61169 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gata6Q61169 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gata6Q61169 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gata6Q61169 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gata6Q61169 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gata6Q61169 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gata6Q61169 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gata6Q61169 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gata6Q61169 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gata6Q61169 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gata6Q61169 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gata6Q61169 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gata6Q61169 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gata6Q61169 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gata6Q61169 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gata6Q61169 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gata6Q61169 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gata6Q61169 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gata6Q61169 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gata6Q61169 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gata6Q61169 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gata6Q61169 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gata6Q61169 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gata6Q61169 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gata6Q61169 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gata6Q61169 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gata6Q61169 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gata6Q61169 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gata6Q61169 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gata6Q61169 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gata6Q61169 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gata6Q61169 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gata6Q61169 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gata6Q61169 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gata6Q61169 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gata6Q61169 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gata6Q61169 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gata6Q61169 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gata6Q61169 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gata6Q61169 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gata6Q61169 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gata6Q61169 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gata6Q61169 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gata6Q61169 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gata6Q61169 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gata6Q61169 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gata6Q61169 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gata6Q61169 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gata6Q61169 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gata6Q61169 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gata6Q61169 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gata6Q61169 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gata6Q61169 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gata6Q61169 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gata6Q61169 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gata6Q61169 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gata6Q61169 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms