Protein–RNA interactions for Protein: Q60870

Reep5, Receptor expression-enhancing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep5Q60870 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Reep5Q60870 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,38■■□□□ 1,17
Reep5Q60870 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Reep5Q60870 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Reep5Q60870 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Reep5Q60870 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Reep5Q60870 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Reep5Q60870 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Reep5Q60870 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Reep5Q60870 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Reep5Q60870 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Reep5Q60870 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,16■■□□□ 1,14
Reep5Q60870 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Reep5Q60870 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Reep5Q60870 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Reep5Q60870 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Reep5Q60870 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,12■■□□□ 1,13
Reep5Q60870 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Reep5Q60870 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Reep5Q60870 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Reep5Q60870 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
Reep5Q60870 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Reep5Q60870 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Reep5Q60870 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Reep5Q60870 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Reep5Q60870 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,95■■□□□ 1,1
Reep5Q60870 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Reep5Q60870 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Reep5Q60870 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Reep5Q60870 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Reep5Q60870 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Reep5Q60870 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Reep5Q60870 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Reep5Q60870 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Reep5Q60870 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Reep5Q60870 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Reep5Q60870 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Reep5Q60870 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Reep5Q60870 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Reep5Q60870 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Reep5Q60870 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Reep5Q60870 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
Reep5Q60870 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Reep5Q60870 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Reep5Q60870 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Reep5Q60870 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Reep5Q60870 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Reep5Q60870 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
Reep5Q60870 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
Reep5Q60870 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Reep5Q60870 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
Reep5Q60870 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Reep5Q60870 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Reep5Q60870 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Reep5Q60870 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Reep5Q60870 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Reep5Q60870 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Reep5Q60870 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Reep5Q60870 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Reep5Q60870 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Reep5Q60870 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Reep5Q60870 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Reep5Q60870 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Reep5Q60870 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Reep5Q60870 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Reep5Q60870 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Reep5Q60870 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Reep5Q60870 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
Reep5Q60870 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Reep5Q60870 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Reep5Q60870 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Reep5Q60870 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,45■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Reep5Q60870 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Reep5Q60870 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Reep5Q60870 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Reep5Q60870 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Reep5Q60870 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Reep5Q60870 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Reep5Q60870 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Reep5Q60870 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Reep5Q60870 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Reep5Q60870 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Reep5Q60870 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Reep5Q60870 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Reep5Q60870 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,3■■□□□ 1
Reep5Q60870 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Reep5Q60870 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Reep5Q60870 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Reep5Q60870 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Reep5Q60870 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms