Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Rasa3Q60790 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Rasa3Q60790 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
Rasa3Q60790 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Rasa3Q60790 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Rasa3Q60790 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Rasa3Q60790 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Rasa3Q60790 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Rasa3Q60790 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Rasa3Q60790 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Rasa3Q60790 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Rasa3Q60790 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Rasa3Q60790 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Rasa3Q60790 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Rasa3Q60790 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Rasa3Q60790 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Rasa3Q60790 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Rasa3Q60790 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Rasa3Q60790 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Rasa3Q60790 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
Rasa3Q60790 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Rasa3Q60790 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Rasa3Q60790 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Rasa3Q60790 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Rasa3Q60790 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Rasa3Q60790 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,47■■■□□ 2,79
Rasa3Q60790 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Rasa3Q60790 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Rasa3Q60790 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Rasa3Q60790 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Rasa3Q60790 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Rasa3Q60790 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Rasa3Q60790 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Rasa3Q60790 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32,31■■■□□ 2,76
Rasa3Q60790 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Rasa3Q60790 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Rasa3Q60790 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Rasa3Q60790 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Rasa3Q60790 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Rasa3Q60790 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32,18■■■□□ 2,74
Rasa3Q60790 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Rasa3Q60790 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Rasa3Q60790 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
Rasa3Q60790 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Rasa3Q60790 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,08■■■□□ 2,73
Rasa3Q60790 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Rasa3Q60790 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Rasa3Q60790 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Rasa3Q60790 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32■■■□□ 2,71
Rasa3Q60790 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Rasa3Q60790 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31,97■■■□□ 2,71
Rasa3Q60790 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Rasa3Q60790 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Rasa3Q60790 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Rasa3Q60790 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,93■■■□□ 2,7
Rasa3Q60790 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Rasa3Q60790 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Rasa3Q60790 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Rasa3Q60790 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Rasa3Q60790 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Rasa3Q60790 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Rasa3Q60790 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Rasa3Q60790 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Rasa3Q60790 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Rasa3Q60790 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Rasa3Q60790 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Rasa3Q60790 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Rasa3Q60790 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Rasa3Q60790 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Rasa3Q60790 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
Rasa3Q60790 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Rasa3Q60790 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Rasa3Q60790 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Rasa3Q60790 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Rasa3Q60790 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,54■■■□□ 2,64
Rasa3Q60790 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Rasa3Q60790 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Rasa3Q60790 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31,48■■■□□ 2,63
Rasa3Q60790 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Rasa3Q60790 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Rasa3Q60790 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Rasa3Q60790 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Rasa3Q60790 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Rasa3Q60790 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Rasa3Q60790 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,43■■■□□ 2,62
Rasa3Q60790 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Rasa3Q60790 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31,36■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,61
Rasa3Q60790 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31,31■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Rasa3Q60790 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,2 ms