Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Satb1Q60611 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Satb1Q60611 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Satb1Q60611 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Satb1Q60611 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Satb1Q60611 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Satb1Q60611 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Satb1Q60611 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Satb1Q60611 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Satb1Q60611 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Satb1Q60611 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Satb1Q60611 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Satb1Q60611 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Satb1Q60611 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Satb1Q60611 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Satb1Q60611 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Satb1Q60611 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Satb1Q60611 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Satb1Q60611 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Satb1Q60611 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Satb1Q60611 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Satb1Q60611 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Satb1Q60611 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Satb1Q60611 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Satb1Q60611 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Satb1Q60611 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Satb1Q60611 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Satb1Q60611 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Satb1Q60611 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Satb1Q60611 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Satb1Q60611 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Satb1Q60611 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Satb1Q60611 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Satb1Q60611 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Satb1Q60611 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Satb1Q60611 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Satb1Q60611 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Satb1Q60611 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Satb1Q60611 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Satb1Q60611 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Satb1Q60611 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Satb1Q60611 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Satb1Q60611 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Satb1Q60611 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Satb1Q60611 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Satb1Q60611 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Satb1Q60611 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Satb1Q60611 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Satb1Q60611 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Satb1Q60611 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Satb1Q60611 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Satb1Q60611 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Satb1Q60611 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Satb1Q60611 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Satb1Q60611 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Satb1Q60611 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Satb1Q60611 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Satb1Q60611 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Satb1Q60611 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Satb1Q60611 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Satb1Q60611 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Satb1Q60611 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Satb1Q60611 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Satb1Q60611 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Satb1Q60611 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Satb1Q60611 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Satb1Q60611 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Satb1Q60611 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Satb1Q60611 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Satb1Q60611 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Satb1Q60611 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Satb1Q60611 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Satb1Q60611 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Satb1Q60611 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Satb1Q60611 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Satb1Q60611 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Satb1Q60611 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Satb1Q60611 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Satb1Q60611 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Satb1Q60611 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Satb1Q60611 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Satb1Q60611 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Satb1Q60611 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Satb1Q60611 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Satb1Q60611 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Satb1Q60611 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Satb1Q60611 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Satb1Q60611 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Satb1Q60611 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Satb1Q60611 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Satb1Q60611 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Satb1Q60611 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Satb1Q60611 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Satb1Q60611 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Satb1Q60611 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Satb1Q60611 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Satb1Q60611 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Satb1Q60611 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Satb1Q60611 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Satb1Q60611 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms