Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Arhgap44Q5SSM3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arhgap44Q5SSM3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Arhgap44Q5SSM3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Arhgap44Q5SSM3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Arhgap44Q5SSM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgap44Q5SSM3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Arhgap44Q5SSM3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgap44Q5SSM3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgap44Q5SSM3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgap44Q5SSM3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgap44Q5SSM3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgap44Q5SSM3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arhgap44Q5SSM3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Arhgap44Q5SSM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Arhgap44Q5SSM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arhgap44Q5SSM3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arhgap44Q5SSM3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Arhgap44Q5SSM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Arhgap44Q5SSM3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Arhgap44Q5SSM3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Arhgap44Q5SSM3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Arhgap44Q5SSM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Arhgap44Q5SSM3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Arhgap44Q5SSM3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Arhgap44Q5SSM3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arhgap44Q5SSM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arhgap44Q5SSM3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Arhgap44Q5SSM3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arhgap44Q5SSM3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arhgap44Q5SSM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Arhgap44Q5SSM3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arhgap44Q5SSM3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Arhgap44Q5SSM3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Arhgap44Q5SSM3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arhgap44Q5SSM3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Arhgap44Q5SSM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgap44Q5SSM3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Arhgap44Q5SSM3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Arhgap44Q5SSM3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Arhgap44Q5SSM3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arhgap44Q5SSM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Arhgap44Q5SSM3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Arhgap44Q5SSM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Arhgap44Q5SSM3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Arhgap44Q5SSM3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgap44Q5SSM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Arhgap44Q5SSM3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Arhgap44Q5SSM3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Arhgap44Q5SSM3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgap44Q5SSM3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arhgap44Q5SSM3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arhgap44Q5SSM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arhgap44Q5SSM3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgap44Q5SSM3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgap44Q5SSM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgap44Q5SSM3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arhgap44Q5SSM3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgap44Q5SSM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Arhgap44Q5SSM3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Arhgap44Q5SSM3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arhgap44Q5SSM3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arhgap44Q5SSM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Arhgap44Q5SSM3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgap44Q5SSM3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arhgap44Q5SSM3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgap44Q5SSM3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arhgap44Q5SSM3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgap44Q5SSM3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgap44Q5SSM3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Arhgap44Q5SSM3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Arhgap44Q5SSM3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Arhgap44Q5SSM3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Arhgap44Q5SSM3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Arhgap44Q5SSM3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Arhgap44Q5SSM3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Arhgap44Q5SSM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Arhgap44Q5SSM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Arhgap44Q5SSM3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Arhgap44Q5SSM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Arhgap44Q5SSM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Arhgap44Q5SSM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Arhgap44Q5SSM3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Arhgap44Q5SSM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arhgap44Q5SSM3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arhgap44Q5SSM3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Arhgap44Q5SSM3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Arhgap44Q5SSM3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arhgap44Q5SSM3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms