Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Zdbf2Q5SS00 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Zdbf2Q5SS00 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Zdbf2Q5SS00 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Zdbf2Q5SS00 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Zdbf2Q5SS00 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,06
Zdbf2Q5SS00 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Zdbf2Q5SS00 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Zdbf2Q5SS00 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Zdbf2Q5SS00 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Zdbf2Q5SS00 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Zdbf2Q5SS00 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Zdbf2Q5SS00 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Zdbf2Q5SS00 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,89■■■■□ 3,02
Zdbf2Q5SS00 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Zdbf2Q5SS00 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Zdbf2Q5SS00 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Zdbf2Q5SS00 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Zdbf2Q5SS00 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Zdbf2Q5SS00 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Zdbf2Q5SS00 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Zdbf2Q5SS00 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Zdbf2Q5SS00 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Zdbf2Q5SS00 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Zdbf2Q5SS00 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,58■■■□□ 2,97
Zdbf2Q5SS00 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Zdbf2Q5SS00 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Zdbf2Q5SS00 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Zdbf2Q5SS00 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,5■■■□□ 2,95
Zdbf2Q5SS00 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Zdbf2Q5SS00 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,46■■■□□ 2,95
Zdbf2Q5SS00 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Zdbf2Q5SS00 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Zdbf2Q5SS00 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Zdbf2Q5SS00 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Zdbf2Q5SS00 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,42■■■□□ 2,94
Zdbf2Q5SS00 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33,42■■■□□ 2,94
Zdbf2Q5SS00 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Zdbf2Q5SS00 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Zdbf2Q5SS00 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33,41■■■□□ 2,94
Zdbf2Q5SS00 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Zdbf2Q5SS00 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Zdbf2Q5SS00 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Zdbf2Q5SS00 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
Zdbf2Q5SS00 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Zdbf2Q5SS00 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Zdbf2Q5SS00 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,32■■■□□ 2,92
Zdbf2Q5SS00 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,32■■■□□ 2,92
Zdbf2Q5SS00 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33,31■■■□□ 2,92
Zdbf2Q5SS00 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Zdbf2Q5SS00 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Zdbf2Q5SS00 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Zdbf2Q5SS00 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Zdbf2Q5SS00 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Zdbf2Q5SS00 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Zdbf2Q5SS00 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Zdbf2Q5SS00 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Zdbf2Q5SS00 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,13■■■□□ 2,89
Zdbf2Q5SS00 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Zdbf2Q5SS00 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Zdbf2Q5SS00 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Zdbf2Q5SS00 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,04■■■□□ 2,88
Zdbf2Q5SS00 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33,04■■■□□ 2,88
Zdbf2Q5SS00 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Zdbf2Q5SS00 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2,87
Zdbf2Q5SS00 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Zdbf2Q5SS00 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Zdbf2Q5SS00 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Zdbf2Q5SS00 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Zdbf2Q5SS00 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Zdbf2Q5SS00 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Zdbf2Q5SS00 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Zdbf2Q5SS00 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Zdbf2Q5SS00 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Zdbf2Q5SS00 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Zdbf2Q5SS00 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Zdbf2Q5SS00 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Zdbf2Q5SS00 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Zdbf2Q5SS00 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Zdbf2Q5SS00 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32,84■■■□□ 2,85
Zdbf2Q5SS00 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Zdbf2Q5SS00 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Zdbf2Q5SS00 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Zdbf2Q5SS00 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Zdbf2Q5SS00 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Zdbf2Q5SS00 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Zdbf2Q5SS00 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32,7■■■□□ 2,82
Zdbf2Q5SS00 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Zdbf2Q5SS00 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Zdbf2Q5SS00 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Zdbf2Q5SS00 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Zdbf2Q5SS00 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Zdbf2Q5SS00 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32,57■■■□□ 2,8
Zdbf2Q5SS00 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Zdbf2Q5SS00 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Zdbf2Q5SS00 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Zdbf2Q5SS00 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Zdbf2Q5SS00 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Zdbf2Q5SS00 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32,45■■■□□ 2,79
Zdbf2Q5SS00 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,1 ms