Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCX5

Neurl4, Neuralized-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl4Q5NCX5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,54■■■■■ 4,4
Neurl4Q5NCX5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Neurl4Q5NCX5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,49■■■■■ 4,39
Neurl4Q5NCX5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,49■■■■■ 4,39
Neurl4Q5NCX5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
Neurl4Q5NCX5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,39
Neurl4Q5NCX5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42,44■■■■■ 4,38
Neurl4Q5NCX5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,43■■■■■ 4,38
Neurl4Q5NCX5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,42■■■■■ 4,38
Neurl4Q5NCX5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC42,41■■■■■ 4,38
Neurl4Q5NCX5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,4■■■■■ 4,38
Neurl4Q5NCX5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
Neurl4Q5NCX5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42,36■■■■■ 4,37
Neurl4Q5NCX5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,36■■■■■ 4,37
Neurl4Q5NCX5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,31■■■■■ 4,36
Neurl4Q5NCX5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42,29■■■■■ 4,36
Neurl4Q5NCX5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,27■■■■■ 4,36
Neurl4Q5NCX5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42,24■■■■■ 4,35
Neurl4Q5NCX5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,23■■■■■ 4,35
Neurl4Q5NCX5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42,2■■■■■ 4,35
Neurl4Q5NCX5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42,17■■■■■ 4,34
Neurl4Q5NCX5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,13■■■■■ 4,33
Neurl4Q5NCX5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42,08■■■■■ 4,33
Neurl4Q5NCX5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,04■■■■■ 4,32
Neurl4Q5NCX5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42,03■■■■■ 4,32
Neurl4Q5NCX5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42,03■■■■■ 4,32
Neurl4Q5NCX5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41,99■■■■■ 4,31
Neurl4Q5NCX5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,93■■■■■ 4,3
Neurl4Q5NCX5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,9■■■■■ 4,3
Neurl4Q5NCX5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,9■■■■■ 4,3
Neurl4Q5NCX5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41,88■■■■■ 4,3
Neurl4Q5NCX5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41,87■■■■■ 4,29
Neurl4Q5NCX5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,82■■■■■ 4,29
Neurl4Q5NCX5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,75■■■■■ 4,27
Neurl4Q5NCX5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41,71■■■■■ 4,27
Neurl4Q5NCX5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,65■■■■■ 4,26
Neurl4Q5NCX5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41,63■■■■■ 4,26
Neurl4Q5NCX5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Neurl4Q5NCX5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,57■■■■■ 4,24
Neurl4Q5NCX5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,56■■■■■ 4,24
Neurl4Q5NCX5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Neurl4Q5NCX5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC41,5■■■■■ 4,23
Neurl4Q5NCX5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Neurl4Q5NCX5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41,45■■■■■ 4,23
Neurl4Q5NCX5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Neurl4Q5NCX5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,41■■■■■ 4,22
Neurl4Q5NCX5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41,38■■■■■ 4,21
Neurl4Q5NCX5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41,37■■■■■ 4,21
Neurl4Q5NCX5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41,36■■■■■ 4,21
Neurl4Q5NCX5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41,34■■■■■ 4,21
Neurl4Q5NCX5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Neurl4Q5NCX5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Neurl4Q5NCX5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC41,27■■■■■ 4,2
Neurl4Q5NCX5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,22■■■■■ 4,19
Neurl4Q5NCX5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC41,21■■■■■ 4,19
Neurl4Q5NCX5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Neurl4Q5NCX5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41,16■■■■■ 4,18
Neurl4Q5NCX5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,11■■■■■ 4,17
Neurl4Q5NCX5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Neurl4Q5NCX5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,97■■■■■ 4,15
Neurl4Q5NCX5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Neurl4Q5NCX5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40,95■■■■■ 4,15
Neurl4Q5NCX5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Neurl4Q5NCX5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,9■■■■■ 4,14
Neurl4Q5NCX5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40,89■■■■■ 4,14
Neurl4Q5NCX5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Neurl4Q5NCX5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,14
Neurl4Q5NCX5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40,87■■■■■ 4,13
Neurl4Q5NCX5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC40,83■■■■■ 4,13
Neurl4Q5NCX5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Neurl4Q5NCX5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Neurl4Q5NCX5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Neurl4Q5NCX5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Neurl4Q5NCX5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40,77■■■■■ 4,12
Neurl4Q5NCX5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40,77■■■■■ 4,12
Neurl4Q5NCX5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,76■■■■■ 4,12
Neurl4Q5NCX5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,75■■■■■ 4,11
Neurl4Q5NCX5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,74■■■■■ 4,11
Neurl4Q5NCX5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC40,71■■■■■ 4,11
Neurl4Q5NCX5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40,71■■■■■ 4,11
Neurl4Q5NCX5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Neurl4Q5NCX5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Neurl4Q5NCX5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Neurl4Q5NCX5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Neurl4Q5NCX5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,63■■■■■ 4,1
Neurl4Q5NCX5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40,59■■■■■ 4,09
Neurl4Q5NCX5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Neurl4Q5NCX5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Neurl4Q5NCX5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Neurl4Q5NCX5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Neurl4Q5NCX5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40,51■■■■■ 4,08
Neurl4Q5NCX5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Neurl4Q5NCX5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Neurl4Q5NCX5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40,44■■■■■ 4,06
Neurl4Q5NCX5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Neurl4Q5NCX5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,43■■■■■ 4,06
Neurl4Q5NCX5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Neurl4Q5NCX5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC40,37■■■■■ 4,05
Neurl4Q5NCX5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC40,37■■■■■ 4,05
Neurl4Q5NCX5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC40,36■■■■■ 4,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms