Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU28

Pcnx2, Pecanex-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pcnx2Q5DU28 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcnx2Q5DU28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcnx2Q5DU28 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcnx2Q5DU28 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcnx2Q5DU28 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcnx2Q5DU28 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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Pcnx2Q5DU28 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcnx2Q5DU28 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcnx2Q5DU28 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcnx2Q5DU28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcnx2Q5DU28 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcnx2Q5DU28 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcnx2Q5DU28 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcnx2Q5DU28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcnx2Q5DU28 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcnx2Q5DU28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcnx2Q5DU28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcnx2Q5DU28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcnx2Q5DU28 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcnx2Q5DU28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcnx2Q5DU28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcnx2Q5DU28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcnx2Q5DU28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcnx2Q5DU28 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcnx2Q5DU28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcnx2Q5DU28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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Pcnx2Q5DU28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcnx2Q5DU28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcnx2Q5DU28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcnx2Q5DU28 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcnx2Q5DU28 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcnx2Q5DU28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcnx2Q5DU28 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcnx2Q5DU28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcnx2Q5DU28 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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Pcnx2Q5DU28 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcnx2Q5DU28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcnx2Q5DU28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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Pcnx2Q5DU28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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Pcnx2Q5DU28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcnx2Q5DU28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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Pcnx2Q5DU28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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Pcnx2Q5DU28 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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Pcnx2Q5DU28 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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Pcnx2Q5DU28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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Pcnx2Q5DU28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcnx2Q5DU28 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcnx2Q5DU28 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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Pcnx2Q5DU28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcnx2Q5DU28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcnx2Q5DU28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcnx2Q5DU28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcnx2Q5DU28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcnx2Q5DU28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcnx2Q5DU28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcnx2Q5DU28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcnx2Q5DU28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcnx2Q5DU28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms