Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1qtnf9Q4ZJN1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1qtnf9Q4ZJN1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1qtnf9Q4ZJN1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf9Q4ZJN1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf9Q4ZJN1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1qtnf9Q4ZJN1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1qtnf9Q4ZJN1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qtnf9Q4ZJN1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qtnf9Q4ZJN1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qtnf9Q4ZJN1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qtnf9Q4ZJN1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1qtnf9Q4ZJN1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1qtnf9Q4ZJN1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf9Q4ZJN1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf9Q4ZJN1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qtnf9Q4ZJN1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf9Q4ZJN1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf9Q4ZJN1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1qtnf9Q4ZJN1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms