Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL71

Sprr2a3, Small proline-rich protein 2A3, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr2a3Q4KL71 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,18□□□□□ -0,46
Sprr2a3Q4KL71 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC12,17□□□□□ -0,46
Sprr2a3Q4KL71 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12,17□□□□□ -0,46
Sprr2a3Q4KL71 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC12,16□□□□□ -0,46
Sprr2a3Q4KL71 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,15□□□□□ -0,46
Sprr2a3Q4KL71 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,12□□□□□ -0,47
Sprr2a3Q4KL71 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12,11□□□□□ -0,47
Sprr2a3Q4KL71 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,09□□□□□ -0,47
Sprr2a3Q4KL71 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,08□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC12,08□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC12,08□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,08□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,06□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,05□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,05□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,04□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC12,03□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC12,03□□□□□ -0,48
Sprr2a3Q4KL71 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC12,01□□□□□ -0,49
Sprr2a3Q4KL71 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,99□□□□□ -0,49
Sprr2a3Q4KL71 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11,99□□□□□ -0,49
Sprr2a3Q4KL71 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,97□□□□□ -0,49
Sprr2a3Q4KL71 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC11,97□□□□□ -0,49
Sprr2a3Q4KL71 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,97□□□□□ -0,49
Sprr2a3Q4KL71 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,96□□□□□ -0,49
Sprr2a3Q4KL71 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,96□□□□□ -0,49
Sprr2a3Q4KL71 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11,95□□□□□ -0,5
Sprr2a3Q4KL71 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,95□□□□□ -0,5
Sprr2a3Q4KL71 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC11,95□□□□□ -0,5
Sprr2a3Q4KL71 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,94□□□□□ -0,5
Sprr2a3Q4KL71 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC11,92□□□□□ -0,5
Sprr2a3Q4KL71 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11,91□□□□□ -0,5
Sprr2a3Q4KL71 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC11,9□□□□□ -0,5
Sprr2a3Q4KL71 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC11,9□□□□□ -0,5
Sprr2a3Q4KL71 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC11,89□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,89□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC11,88□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11,86□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,86□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,86□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,86□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC11,85□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11,85□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC11,84□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11,83□□□□□ -0,51
Sprr2a3Q4KL71 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC11,81□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11,81□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11,81□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11,81□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC11,79□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11,79□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC11,78□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11,78□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,78□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,78□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11,77□□□□□ -0,52
Sprr2a3Q4KL71 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC11,77□□□□□ -0,53
Sprr2a3Q4KL71 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,77□□□□□ -0,53
Sprr2a3Q4KL71 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11,77□□□□□ -0,53
Sprr2a3Q4KL71 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11,73□□□□□ -0,53
Sprr2a3Q4KL71 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,73□□□□□ -0,53
Sprr2a3Q4KL71 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC11,71□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,7□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC11,7□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC11,7□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11,7□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11,69□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,69□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC11,69□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC11,69□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11,69□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11,68□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11,68□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,67□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,67□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11,66□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC11,66□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11,66□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,66□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11,65□□□□□ -0,54
Sprr2a3Q4KL71 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,64□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11,63□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11,62□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,62□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11,62□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11,62□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11,62□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,62□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,61□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11,6□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC11,6□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,6□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11,6□□□□□ -0,55
Sprr2a3Q4KL71 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11,58□□□□□ -0,56
Sprr2a3Q4KL71 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC11,58□□□□□ -0,56
Sprr2a3Q4KL71 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,58□□□□□ -0,56
Sprr2a3Q4KL71 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11,57□□□□□ -0,56
Sprr2a3Q4KL71 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11,57□□□□□ -0,56
Sprr2a3Q4KL71 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC11,56□□□□□ -0,56
Sprr2a3Q4KL71 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11,55□□□□□ -0,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms