Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,45■■■□□ 2,78
Ulk4Q3V129 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Ulk4Q3V129 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Ulk4Q3V129 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Ulk4Q3V129 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Ulk4Q3V129 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Ulk4Q3V129 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,77
Ulk4Q3V129 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Ulk4Q3V129 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
Ulk4Q3V129 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Ulk4Q3V129 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Ulk4Q3V129 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32,12■■■□□ 2,73
Ulk4Q3V129 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Ulk4Q3V129 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Ulk4Q3V129 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Ulk4Q3V129 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Ulk4Q3V129 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Ulk4Q3V129 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Ulk4Q3V129 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,93■■■□□ 2,7
Ulk4Q3V129 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Ulk4Q3V129 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Ulk4Q3V129 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Ulk4Q3V129 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Ulk4Q3V129 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,83■■■□□ 2,69
Ulk4Q3V129 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Ulk4Q3V129 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Ulk4Q3V129 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Ulk4Q3V129 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,8■■■□□ 2,68
Ulk4Q3V129 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Ulk4Q3V129 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,68
Ulk4Q3V129 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Ulk4Q3V129 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Ulk4Q3V129 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Ulk4Q3V129 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Ulk4Q3V129 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Ulk4Q3V129 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,56■■■□□ 2,64
Ulk4Q3V129 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Ulk4Q3V129 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Ulk4Q3V129 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Ulk4Q3V129 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Ulk4Q3V129 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Ulk4Q3V129 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Ulk4Q3V129 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Ulk4Q3V129 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Ulk4Q3V129 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Ulk4Q3V129 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Ulk4Q3V129 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Ulk4Q3V129 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Ulk4Q3V129 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Ulk4Q3V129 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
Ulk4Q3V129 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Ulk4Q3V129 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Ulk4Q3V129 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31,34■■■□□ 2,61
Ulk4Q3V129 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Ulk4Q3V129 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Ulk4Q3V129 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Ulk4Q3V129 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Ulk4Q3V129 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Ulk4Q3V129 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Ulk4Q3V129 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
Ulk4Q3V129 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Ulk4Q3V129 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,59
Ulk4Q3V129 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Ulk4Q3V129 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Ulk4Q3V129 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Ulk4Q3V129 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Ulk4Q3V129 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Ulk4Q3V129 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Ulk4Q3V129 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Ulk4Q3V129 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Ulk4Q3V129 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Ulk4Q3V129 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Ulk4Q3V129 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Ulk4Q3V129 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Ulk4Q3V129 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Ulk4Q3V129 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Ulk4Q3V129 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Ulk4Q3V129 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Ulk4Q3V129 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Ulk4Q3V129 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Ulk4Q3V129 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Ulk4Q3V129 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Ulk4Q3V129 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Ulk4Q3V129 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Ulk4Q3V129 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
Ulk4Q3V129 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Ulk4Q3V129 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Ulk4Q3V129 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,72■■■□□ 2,51
Ulk4Q3V129 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Ulk4Q3V129 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Ulk4Q3V129 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,5
Ulk4Q3V129 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Ulk4Q3V129 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Ulk4Q3V129 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Ulk4Q3V129 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Ulk4Q3V129 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Ulk4Q3V129 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Ulk4Q3V129 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Ulk4Q3V129 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Ulk4Q3V129 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,5 ms