Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Usp48Q3V0C5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Usp48Q3V0C5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Usp48Q3V0C5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Usp48Q3V0C5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Usp48Q3V0C5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Usp48Q3V0C5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Usp48Q3V0C5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Usp48Q3V0C5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Usp48Q3V0C5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Usp48Q3V0C5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Usp48Q3V0C5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Usp48Q3V0C5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Usp48Q3V0C5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Usp48Q3V0C5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Usp48Q3V0C5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Usp48Q3V0C5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Usp48Q3V0C5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Usp48Q3V0C5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Usp48Q3V0C5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Usp48Q3V0C5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Usp48Q3V0C5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Usp48Q3V0C5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Usp48Q3V0C5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Usp48Q3V0C5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Usp48Q3V0C5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Usp48Q3V0C5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Usp48Q3V0C5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Usp48Q3V0C5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Usp48Q3V0C5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Usp48Q3V0C5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Usp48Q3V0C5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Usp48Q3V0C5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Usp48Q3V0C5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Usp48Q3V0C5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Usp48Q3V0C5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Usp48Q3V0C5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Usp48Q3V0C5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Usp48Q3V0C5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Usp48Q3V0C5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Usp48Q3V0C5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Usp48Q3V0C5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Usp48Q3V0C5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Usp48Q3V0C5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Usp48Q3V0C5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp48Q3V0C5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp48Q3V0C5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Usp48Q3V0C5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Usp48Q3V0C5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Usp48Q3V0C5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Usp48Q3V0C5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp48Q3V0C5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp48Q3V0C5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Usp48Q3V0C5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Usp48Q3V0C5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Usp48Q3V0C5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Usp48Q3V0C5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Usp48Q3V0C5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Usp48Q3V0C5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Usp48Q3V0C5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Usp48Q3V0C5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Usp48Q3V0C5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Usp48Q3V0C5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Usp48Q3V0C5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Usp48Q3V0C5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Usp48Q3V0C5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Usp48Q3V0C5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Usp48Q3V0C5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Usp48Q3V0C5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Usp48Q3V0C5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Usp48Q3V0C5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Usp48Q3V0C5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Usp48Q3V0C5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp48Q3V0C5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Usp48Q3V0C5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Usp48Q3V0C5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Usp48Q3V0C5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Usp48Q3V0C5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp48Q3V0C5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Usp48Q3V0C5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Usp48Q3V0C5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Usp48Q3V0C5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp48Q3V0C5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Usp48Q3V0C5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp48Q3V0C5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp48Q3V0C5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Usp48Q3V0C5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Usp48Q3V0C5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp48Q3V0C5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp48Q3V0C5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Usp48Q3V0C5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Usp48Q3V0C5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Usp48Q3V0C5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Usp48Q3V0C5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Usp48Q3V0C5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Usp48Q3V0C5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Usp48Q3V0C5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp48Q3V0C5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp48Q3V0C5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp48Q3V0C5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms