Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY29

Gm5464, Predicted gene 5464, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5464Q3UY29 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Gm5464Q3UY29 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Gm5464Q3UY29 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Gm5464Q3UY29 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Gm5464Q3UY29 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Gm5464Q3UY29 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Gm5464Q3UY29 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,61■■□□□ 1,05
Gm5464Q3UY29 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Gm5464Q3UY29 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Gm5464Q3UY29 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21,58■■□□□ 1,05
Gm5464Q3UY29 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Gm5464Q3UY29 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Gm5464Q3UY29 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Gm5464Q3UY29 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Gm5464Q3UY29 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21,44■■□□□ 1,02
Gm5464Q3UY29 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Gm5464Q3UY29 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Gm5464Q3UY29 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Gm5464Q3UY29 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Gm5464Q3UY29 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Gm5464Q3UY29 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Gm5464Q3UY29 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Gm5464Q3UY29 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21,36■■□□□ 1,01
Gm5464Q3UY29 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Gm5464Q3UY29 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Gm5464Q3UY29 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Gm5464Q3UY29 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Gm5464Q3UY29 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,29■■□□□ 1
Gm5464Q3UY29 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Gm5464Q3UY29 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,28■■□□□ 1
Gm5464Q3UY29 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,24■□□□□ 0,99
Gm5464Q3UY29 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Gm5464Q3UY29 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Gm5464Q3UY29 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Gm5464Q3UY29 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Gm5464Q3UY29 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Gm5464Q3UY29 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Gm5464Q3UY29 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Gm5464Q3UY29 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Gm5464Q3UY29 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Gm5464Q3UY29 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Gm5464Q3UY29 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Gm5464Q3UY29 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Gm5464Q3UY29 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Gm5464Q3UY29 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Gm5464Q3UY29 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20,99■□□□□ 0,95
Gm5464Q3UY29 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Gm5464Q3UY29 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Gm5464Q3UY29 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Gm5464Q3UY29 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20,94■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20,94■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20,94■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Gm5464Q3UY29 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Gm5464Q3UY29 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Gm5464Q3UY29 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Gm5464Q3UY29 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Gm5464Q3UY29 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20,82■□□□□ 0,92
Gm5464Q3UY29 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Gm5464Q3UY29 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Gm5464Q3UY29 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Gm5464Q3UY29 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Gm5464Q3UY29 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Gm5464Q3UY29 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Gm5464Q3UY29 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gm5464Q3UY29 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Gm5464Q3UY29 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Gm5464Q3UY29 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Gm5464Q3UY29 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Gm5464Q3UY29 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Gm5464Q3UY29 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Gm5464Q3UY29 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Gm5464Q3UY29 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Gm5464Q3UY29 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Gm5464Q3UY29 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Gm5464Q3UY29 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Gm5464Q3UY29 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Gm5464Q3UY29 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Gm5464Q3UY29 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Gm5464Q3UY29 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm5464Q3UY29 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Gm5464Q3UY29 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Gm5464Q3UY29 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Gm5464Q3UY29 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,87
Gm5464Q3UY29 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Gm5464Q3UY29 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Gm5464Q3UY29 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Gm5464Q3UY29 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Gm5464Q3UY29 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Gm5464Q3UY29 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Gm5464Q3UY29 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Gm5464Q3UY29 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Gm5464Q3UY29 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms