Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Mindy4Q3UQI9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Mindy4Q3UQI9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Mindy4Q3UQI9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Mindy4Q3UQI9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Mindy4Q3UQI9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Mindy4Q3UQI9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Mindy4Q3UQI9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mindy4Q3UQI9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Mindy4Q3UQI9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Mindy4Q3UQI9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mindy4Q3UQI9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mindy4Q3UQI9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Mindy4Q3UQI9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Mindy4Q3UQI9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Mindy4Q3UQI9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mindy4Q3UQI9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mindy4Q3UQI9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mindy4Q3UQI9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mindy4Q3UQI9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Mindy4Q3UQI9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Mindy4Q3UQI9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Mindy4Q3UQI9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mindy4Q3UQI9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mindy4Q3UQI9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Mindy4Q3UQI9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mindy4Q3UQI9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mindy4Q3UQI9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mindy4Q3UQI9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Mindy4Q3UQI9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Mindy4Q3UQI9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Mindy4Q3UQI9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Mindy4Q3UQI9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mindy4Q3UQI9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Mindy4Q3UQI9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Mindy4Q3UQI9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Mindy4Q3UQI9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Mindy4Q3UQI9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Mindy4Q3UQI9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Mindy4Q3UQI9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Mindy4Q3UQI9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Mindy4Q3UQI9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Mindy4Q3UQI9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mindy4Q3UQI9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mindy4Q3UQI9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mindy4Q3UQI9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mindy4Q3UQI9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mindy4Q3UQI9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mindy4Q3UQI9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mindy4Q3UQI9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mindy4Q3UQI9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mindy4Q3UQI9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mindy4Q3UQI9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mindy4Q3UQI9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mindy4Q3UQI9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mindy4Q3UQI9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mindy4Q3UQI9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Mindy4Q3UQI9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mindy4Q3UQI9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mindy4Q3UQI9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mindy4Q3UQI9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mindy4Q3UQI9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mindy4Q3UQI9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mindy4Q3UQI9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mindy4Q3UQI9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mindy4Q3UQI9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mindy4Q3UQI9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mindy4Q3UQI9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mindy4Q3UQI9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mindy4Q3UQI9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mindy4Q3UQI9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mindy4Q3UQI9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mindy4Q3UQI9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mindy4Q3UQI9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mindy4Q3UQI9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mindy4Q3UQI9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mindy4Q3UQI9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mindy4Q3UQI9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mindy4Q3UQI9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms