Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shisa3Q3UPR0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shisa3Q3UPR0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shisa3Q3UPR0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shisa3Q3UPR0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Shisa3Q3UPR0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shisa3Q3UPR0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shisa3Q3UPR0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shisa3Q3UPR0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shisa3Q3UPR0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shisa3Q3UPR0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shisa3Q3UPR0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shisa3Q3UPR0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shisa3Q3UPR0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shisa3Q3UPR0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shisa3Q3UPR0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shisa3Q3UPR0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shisa3Q3UPR0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shisa3Q3UPR0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shisa3Q3UPR0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shisa3Q3UPR0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Shisa3Q3UPR0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Shisa3Q3UPR0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Shisa3Q3UPR0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shisa3Q3UPR0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shisa3Q3UPR0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Shisa3Q3UPR0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Shisa3Q3UPR0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Shisa3Q3UPR0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shisa3Q3UPR0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Shisa3Q3UPR0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Shisa3Q3UPR0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Shisa3Q3UPR0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Shisa3Q3UPR0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Shisa3Q3UPR0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Shisa3Q3UPR0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shisa3Q3UPR0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shisa3Q3UPR0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shisa3Q3UPR0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shisa3Q3UPR0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shisa3Q3UPR0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shisa3Q3UPR0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisa3Q3UPR0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shisa3Q3UPR0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shisa3Q3UPR0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shisa3Q3UPR0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shisa3Q3UPR0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shisa3Q3UPR0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shisa3Q3UPR0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shisa3Q3UPR0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shisa3Q3UPR0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shisa3Q3UPR0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shisa3Q3UPR0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shisa3Q3UPR0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shisa3Q3UPR0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shisa3Q3UPR0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shisa3Q3UPR0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Shisa3Q3UPR0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shisa3Q3UPR0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shisa3Q3UPR0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Shisa3Q3UPR0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Shisa3Q3UPR0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shisa3Q3UPR0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shisa3Q3UPR0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shisa3Q3UPR0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shisa3Q3UPR0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shisa3Q3UPR0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shisa3Q3UPR0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shisa3Q3UPR0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shisa3Q3UPR0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shisa3Q3UPR0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shisa3Q3UPR0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shisa3Q3UPR0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shisa3Q3UPR0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shisa3Q3UPR0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shisa3Q3UPR0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shisa3Q3UPR0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shisa3Q3UPR0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shisa3Q3UPR0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shisa3Q3UPR0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms