Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rmi2Q3UPE3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rmi2Q3UPE3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rmi2Q3UPE3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rmi2Q3UPE3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rmi2Q3UPE3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rmi2Q3UPE3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rmi2Q3UPE3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rmi2Q3UPE3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rmi2Q3UPE3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rmi2Q3UPE3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rmi2Q3UPE3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rmi2Q3UPE3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rmi2Q3UPE3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rmi2Q3UPE3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rmi2Q3UPE3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmi2Q3UPE3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rmi2Q3UPE3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmi2Q3UPE3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmi2Q3UPE3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rmi2Q3UPE3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rmi2Q3UPE3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rmi2Q3UPE3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rmi2Q3UPE3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rmi2Q3UPE3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rmi2Q3UPE3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rmi2Q3UPE3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rmi2Q3UPE3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rmi2Q3UPE3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rmi2Q3UPE3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rmi2Q3UPE3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rmi2Q3UPE3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rmi2Q3UPE3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rmi2Q3UPE3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmi2Q3UPE3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmi2Q3UPE3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rmi2Q3UPE3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rmi2Q3UPE3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmi2Q3UPE3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rmi2Q3UPE3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rmi2Q3UPE3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rmi2Q3UPE3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rmi2Q3UPE3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rmi2Q3UPE3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rmi2Q3UPE3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rmi2Q3UPE3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rmi2Q3UPE3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rmi2Q3UPE3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rmi2Q3UPE3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rmi2Q3UPE3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rmi2Q3UPE3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmi2Q3UPE3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmi2Q3UPE3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmi2Q3UPE3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmi2Q3UPE3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rmi2Q3UPE3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rmi2Q3UPE3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmi2Q3UPE3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rmi2Q3UPE3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmi2Q3UPE3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rmi2Q3UPE3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rmi2Q3UPE3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rmi2Q3UPE3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rmi2Q3UPE3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rmi2Q3UPE3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rmi2Q3UPE3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmi2Q3UPE3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rmi2Q3UPE3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rmi2Q3UPE3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rmi2Q3UPE3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rmi2Q3UPE3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rmi2Q3UPE3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rmi2Q3UPE3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rmi2Q3UPE3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rmi2Q3UPE3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rmi2Q3UPE3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rmi2Q3UPE3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rmi2Q3UPE3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rmi2Q3UPE3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rmi2Q3UPE3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rmi2Q3UPE3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rmi2Q3UPE3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rmi2Q3UPE3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rmi2Q3UPE3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rmi2Q3UPE3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rmi2Q3UPE3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rmi2Q3UPE3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms