Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem241Q3UME2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem241Q3UME2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem241Q3UME2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem241Q3UME2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem241Q3UME2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem241Q3UME2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem241Q3UME2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem241Q3UME2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem241Q3UME2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem241Q3UME2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem241Q3UME2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem241Q3UME2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem241Q3UME2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem241Q3UME2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem241Q3UME2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem241Q3UME2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem241Q3UME2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem241Q3UME2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem241Q3UME2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem241Q3UME2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem241Q3UME2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem241Q3UME2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem241Q3UME2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem241Q3UME2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem241Q3UME2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem241Q3UME2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem241Q3UME2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem241Q3UME2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem241Q3UME2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem241Q3UME2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem241Q3UME2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem241Q3UME2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem241Q3UME2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem241Q3UME2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem241Q3UME2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem241Q3UME2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem241Q3UME2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem241Q3UME2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem241Q3UME2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem241Q3UME2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem241Q3UME2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem241Q3UME2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem241Q3UME2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem241Q3UME2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tmem241Q3UME2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem241Q3UME2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem241Q3UME2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmem241Q3UME2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem241Q3UME2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem241Q3UME2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem241Q3UME2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem241Q3UME2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem241Q3UME2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem241Q3UME2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem241Q3UME2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem241Q3UME2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem241Q3UME2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem241Q3UME2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem241Q3UME2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem241Q3UME2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem241Q3UME2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem241Q3UME2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem241Q3UME2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem241Q3UME2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem241Q3UME2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem241Q3UME2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem241Q3UME2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem241Q3UME2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem241Q3UME2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem241Q3UME2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem241Q3UME2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem241Q3UME2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem241Q3UME2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem241Q3UME2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmem241Q3UME2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmem241Q3UME2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem241Q3UME2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem241Q3UME2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem241Q3UME2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem241Q3UME2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms