Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Fhdc1Q3ULZ2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Fhdc1Q3ULZ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Fhdc1Q3ULZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Fhdc1Q3ULZ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Fhdc1Q3ULZ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Fhdc1Q3ULZ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Fhdc1Q3ULZ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Fhdc1Q3ULZ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Fhdc1Q3ULZ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Fhdc1Q3ULZ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Fhdc1Q3ULZ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,11
Fhdc1Q3ULZ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Fhdc1Q3ULZ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Fhdc1Q3ULZ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,38■■■■□ 3,09
Fhdc1Q3ULZ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Fhdc1Q3ULZ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Fhdc1Q3ULZ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Fhdc1Q3ULZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Fhdc1Q3ULZ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Fhdc1Q3ULZ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Fhdc1Q3ULZ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,22■■■■□ 3,07
Fhdc1Q3ULZ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Fhdc1Q3ULZ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Fhdc1Q3ULZ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Fhdc1Q3ULZ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Fhdc1Q3ULZ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Fhdc1Q3ULZ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Fhdc1Q3ULZ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Fhdc1Q3ULZ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Fhdc1Q3ULZ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Fhdc1Q3ULZ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Fhdc1Q3ULZ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Fhdc1Q3ULZ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Fhdc1Q3ULZ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Fhdc1Q3ULZ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Fhdc1Q3ULZ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Fhdc1Q3ULZ2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
Fhdc1Q3ULZ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Fhdc1Q3ULZ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Fhdc1Q3ULZ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Fhdc1Q3ULZ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Fhdc1Q3ULZ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Fhdc1Q3ULZ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,77■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,77■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,77■■■■□ 3
Fhdc1Q3ULZ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Fhdc1Q3ULZ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Fhdc1Q3ULZ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Fhdc1Q3ULZ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Fhdc1Q3ULZ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Fhdc1Q3ULZ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Fhdc1Q3ULZ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Fhdc1Q3ULZ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Fhdc1Q3ULZ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,55■■■□□ 2,96
Fhdc1Q3ULZ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Fhdc1Q3ULZ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Fhdc1Q3ULZ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Fhdc1Q3ULZ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Fhdc1Q3ULZ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Fhdc1Q3ULZ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Fhdc1Q3ULZ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,39■■■□□ 2,94
Fhdc1Q3ULZ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,39■■■□□ 2,94
Fhdc1Q3ULZ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Fhdc1Q3ULZ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Fhdc1Q3ULZ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Fhdc1Q3ULZ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Fhdc1Q3ULZ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Fhdc1Q3ULZ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Fhdc1Q3ULZ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Fhdc1Q3ULZ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Fhdc1Q3ULZ2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Fhdc1Q3ULZ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Fhdc1Q3ULZ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Fhdc1Q3ULZ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,2■■■□□ 2,91
Fhdc1Q3ULZ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Fhdc1Q3ULZ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Fhdc1Q3ULZ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
Fhdc1Q3ULZ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Fhdc1Q3ULZ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Fhdc1Q3ULZ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,14■■■□□ 2,9
Fhdc1Q3ULZ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Fhdc1Q3ULZ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Fhdc1Q3ULZ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Fhdc1Q3ULZ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Fhdc1Q3ULZ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Fhdc1Q3ULZ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Fhdc1Q3ULZ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Fhdc1Q3ULZ2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Fhdc1Q3ULZ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,03■■■□□ 2,88
Fhdc1Q3ULZ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Fhdc1Q3ULZ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Fhdc1Q3ULZ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Fhdc1Q3ULZ2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Fhdc1Q3ULZ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms