Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc34Q3UI66 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc34Q3UI66 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc34Q3UI66 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc34Q3UI66 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc34Q3UI66 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc34Q3UI66 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc34Q3UI66 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc34Q3UI66 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc34Q3UI66 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc34Q3UI66 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc34Q3UI66 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc34Q3UI66 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc34Q3UI66 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc34Q3UI66 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc34Q3UI66 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc34Q3UI66 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc34Q3UI66 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc34Q3UI66 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc34Q3UI66 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc34Q3UI66 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc34Q3UI66 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc34Q3UI66 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc34Q3UI66 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc34Q3UI66 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc34Q3UI66 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc34Q3UI66 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc34Q3UI66 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc34Q3UI66 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc34Q3UI66 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc34Q3UI66 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc34Q3UI66 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc34Q3UI66 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc34Q3UI66 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc34Q3UI66 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc34Q3UI66 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc34Q3UI66 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc34Q3UI66 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc34Q3UI66 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc34Q3UI66 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc34Q3UI66 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc34Q3UI66 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc34Q3UI66 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc34Q3UI66 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc34Q3UI66 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc34Q3UI66 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc34Q3UI66 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc34Q3UI66 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc34Q3UI66 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc34Q3UI66 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc34Q3UI66 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc34Q3UI66 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc34Q3UI66 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc34Q3UI66 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc34Q3UI66 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc34Q3UI66 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc34Q3UI66 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc34Q3UI66 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc34Q3UI66 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc34Q3UI66 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc34Q3UI66 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc34Q3UI66 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc34Q3UI66 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc34Q3UI66 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc34Q3UI66 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc34Q3UI66 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc34Q3UI66 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc34Q3UI66 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc34Q3UI66 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc34Q3UI66 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc34Q3UI66 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc34Q3UI66 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc34Q3UI66 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc34Q3UI66 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc34Q3UI66 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc34Q3UI66 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc34Q3UI66 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc34Q3UI66 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc34Q3UI66 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc34Q3UI66 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc34Q3UI66 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc34Q3UI66 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc34Q3UI66 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc34Q3UI66 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc34Q3UI66 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc34Q3UI66 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc34Q3UI66 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc34Q3UI66 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms