Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,58■■■■■ 4,57
Lmod2Q3UHZ5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
Lmod2Q3UHZ5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,53■■■■■ 4,56
Lmod2Q3UHZ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43,52■■■■■ 4,56
Lmod2Q3UHZ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC43,47■■■■■ 4,55
Lmod2Q3UHZ5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,44■■■■■ 4,54
Lmod2Q3UHZ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43,31■■■■■ 4,52
Lmod2Q3UHZ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,25■■■■■ 4,51
Lmod2Q3UHZ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,22■■■■■ 4,51
Lmod2Q3UHZ5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
Lmod2Q3UHZ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,17■■■■■ 4,5
Lmod2Q3UHZ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43,14■■■■■ 4,5
Lmod2Q3UHZ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,12■■■■■ 4,49
Lmod2Q3UHZ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,49
Lmod2Q3UHZ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43,01■■■■■ 4,48
Lmod2Q3UHZ5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4,47
Lmod2Q3UHZ5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4,47
Lmod2Q3UHZ5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,98■■■■■ 4,47
Lmod2Q3UHZ5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Lmod2Q3UHZ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC42,87■■■■■ 4,45
Lmod2Q3UHZ5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC42,81■■■■■ 4,44
Lmod2Q3UHZ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,77■■■■■ 4,44
Lmod2Q3UHZ5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Lmod2Q3UHZ5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,74■■■■■ 4,43
Lmod2Q3UHZ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42,72■■■■■ 4,43
Lmod2Q3UHZ5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,69■■■■■ 4,42
Lmod2Q3UHZ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,65■■■■■ 4,42
Lmod2Q3UHZ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,61■■■■■ 4,41
Lmod2Q3UHZ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42,55■■■■■ 4,4
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,54■■■■■ 4,4
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42,53■■■■■ 4,4
Lmod2Q3UHZ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,5■■■■■ 4,39
Lmod2Q3UHZ5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,44■■■■■ 4,38
Lmod2Q3UHZ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,44■■■■■ 4,38
Lmod2Q3UHZ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42,41■■■■■ 4,38
Lmod2Q3UHZ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,34■■■■■ 4,37
Lmod2Q3UHZ5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,33■■■■■ 4,37
Lmod2Q3UHZ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42,32■■■■■ 4,37
Lmod2Q3UHZ5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42,32■■■■■ 4,37
Lmod2Q3UHZ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42,27■■■■■ 4,36
Lmod2Q3UHZ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42,25■■■■■ 4,35
Lmod2Q3UHZ5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,22■■■■■ 4,35
Lmod2Q3UHZ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42,22■■■■■ 4,35
Lmod2Q3UHZ5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42,19■■■■■ 4,34
Lmod2Q3UHZ5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42,17■■■■■ 4,34
Lmod2Q3UHZ5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Lmod2Q3UHZ5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,15■■■■■ 4,34
Lmod2Q3UHZ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,14■■■■■ 4,34
Lmod2Q3UHZ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Lmod2Q3UHZ5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Lmod2Q3UHZ5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,1■■■■■ 4,33
Lmod2Q3UHZ5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC42,09■■■■■ 4,33
Lmod2Q3UHZ5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42,07■■■■■ 4,33
Lmod2Q3UHZ5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42,05■■■■■ 4,32
Lmod2Q3UHZ5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4,31
Lmod2Q3UHZ5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41,96■■■■■ 4,31
Lmod2Q3UHZ5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
Lmod2Q3UHZ5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,91■■■■■ 4,3
Lmod2Q3UHZ5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41,87■■■■■ 4,29
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC41,86■■■■■ 4,29
Lmod2Q3UHZ5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41,84■■■■■ 4,29
Lmod2Q3UHZ5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,83■■■■■ 4,29
Lmod2Q3UHZ5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC41,79■■■■■ 4,28
Lmod2Q3UHZ5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,76■■■■■ 4,28
Lmod2Q3UHZ5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,75■■■■■ 4,27
Lmod2Q3UHZ5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41,69■■■■■ 4,27
Lmod2Q3UHZ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,66■■■■■ 4,26
Lmod2Q3UHZ5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41,65■■■■■ 4,26
Lmod2Q3UHZ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC41,61■■■■■ 4,25
Lmod2Q3UHZ5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,6■■■■■ 4,25
Lmod2Q3UHZ5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,57■■■■■ 4,25
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC41,54■■■■■ 4,24
Lmod2Q3UHZ5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Lmod2Q3UHZ5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC41,45■■■■■ 4,23
Lmod2Q3UHZ5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC41,45■■■■■ 4,23
Lmod2Q3UHZ5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,43■■■■■ 4,22
Lmod2Q3UHZ5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Lmod2Q3UHZ5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC41,38■■■■■ 4,21
Lmod2Q3UHZ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
Lmod2Q3UHZ5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,21
Lmod2Q3UHZ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41,31■■■■■ 4,2
Lmod2Q3UHZ5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,3■■■■■ 4,2
Lmod2Q3UHZ5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,27■■■■■ 4,2
Lmod2Q3UHZ5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41,27■■■■■ 4,2
Lmod2Q3UHZ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,25■■■■■ 4,19
Lmod2Q3UHZ5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41,25■■■■■ 4,19
Lmod2Q3UHZ5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Lmod2Q3UHZ5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC41,24■■■■■ 4,19
Lmod2Q3UHZ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Lmod2Q3UHZ5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Lmod2Q3UHZ5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Lmod2Q3UHZ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41,2■■■■■ 4,19
Lmod2Q3UHZ5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Lmod2Q3UHZ5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
Lmod2Q3UHZ5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC41,15■■■■■ 4,18
Lmod2Q3UHZ5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC41,15■■■■■ 4,18
Lmod2Q3UHZ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Lmod2Q3UHZ5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,08■■■■■ 4,17
Lmod2Q3UHZ5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41,05■■■■■ 4,16
Lmod2Q3UHZ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms