Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Snx27Q3UHD6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Snx27Q3UHD6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Snx27Q3UHD6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,7■■■□□ 2,51
Snx27Q3UHD6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Snx27Q3UHD6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Snx27Q3UHD6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Snx27Q3UHD6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Snx27Q3UHD6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,49
Snx27Q3UHD6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Snx27Q3UHD6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Snx27Q3UHD6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Snx27Q3UHD6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
Snx27Q3UHD6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Snx27Q3UHD6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Snx27Q3UHD6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,45■■■□□ 2,46
Snx27Q3UHD6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Snx27Q3UHD6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Snx27Q3UHD6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Snx27Q3UHD6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Snx27Q3UHD6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Snx27Q3UHD6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Snx27Q3UHD6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Snx27Q3UHD6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Snx27Q3UHD6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Snx27Q3UHD6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Snx27Q3UHD6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Snx27Q3UHD6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Snx27Q3UHD6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Snx27Q3UHD6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Snx27Q3UHD6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Snx27Q3UHD6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Snx27Q3UHD6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Snx27Q3UHD6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Snx27Q3UHD6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Snx27Q3UHD6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Snx27Q3UHD6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Snx27Q3UHD6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Snx27Q3UHD6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Snx27Q3UHD6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Snx27Q3UHD6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Snx27Q3UHD6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Snx27Q3UHD6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Snx27Q3UHD6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Snx27Q3UHD6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Snx27Q3UHD6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Snx27Q3UHD6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Snx27Q3UHD6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Snx27Q3UHD6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Snx27Q3UHD6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Snx27Q3UHD6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Snx27Q3UHD6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Snx27Q3UHD6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Snx27Q3UHD6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Snx27Q3UHD6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Snx27Q3UHD6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Snx27Q3UHD6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Snx27Q3UHD6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Snx27Q3UHD6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Snx27Q3UHD6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Snx27Q3UHD6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Snx27Q3UHD6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Snx27Q3UHD6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Snx27Q3UHD6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Snx27Q3UHD6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Snx27Q3UHD6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Snx27Q3UHD6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Snx27Q3UHD6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Snx27Q3UHD6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Snx27Q3UHD6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Snx27Q3UHD6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Snx27Q3UHD6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Snx27Q3UHD6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Snx27Q3UHD6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Snx27Q3UHD6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Snx27Q3UHD6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Snx27Q3UHD6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Snx27Q3UHD6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Snx27Q3UHD6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Snx27Q3UHD6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Snx27Q3UHD6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Snx27Q3UHD6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Snx27Q3UHD6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Snx27Q3UHD6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Snx27Q3UHD6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Snx27Q3UHD6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Snx27Q3UHD6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Snx27Q3UHD6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Snx27Q3UHD6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Snx27Q3UHD6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Snx27Q3UHD6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Snx27Q3UHD6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Snx27Q3UHD6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Snx27Q3UHD6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx27Q3UHD6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx27Q3UHD6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Snx27Q3UHD6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Snx27Q3UHD6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2,23
Snx27Q3UHD6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Snx27Q3UHD6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms