Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Yipf3Q3UDR8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Yipf3Q3UDR8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yipf3Q3UDR8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Yipf3Q3UDR8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Yipf3Q3UDR8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Yipf3Q3UDR8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Yipf3Q3UDR8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Yipf3Q3UDR8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Yipf3Q3UDR8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Yipf3Q3UDR8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Yipf3Q3UDR8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Yipf3Q3UDR8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Yipf3Q3UDR8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Yipf3Q3UDR8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Yipf3Q3UDR8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Yipf3Q3UDR8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Yipf3Q3UDR8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Yipf3Q3UDR8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Yipf3Q3UDR8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Yipf3Q3UDR8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Yipf3Q3UDR8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Yipf3Q3UDR8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Yipf3Q3UDR8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Yipf3Q3UDR8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Yipf3Q3UDR8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Yipf3Q3UDR8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Yipf3Q3UDR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Yipf3Q3UDR8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf3Q3UDR8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Yipf3Q3UDR8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf3Q3UDR8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Yipf3Q3UDR8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Yipf3Q3UDR8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Yipf3Q3UDR8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Yipf3Q3UDR8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Yipf3Q3UDR8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Yipf3Q3UDR8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Yipf3Q3UDR8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Yipf3Q3UDR8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Yipf3Q3UDR8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Yipf3Q3UDR8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Yipf3Q3UDR8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Yipf3Q3UDR8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Yipf3Q3UDR8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Yipf3Q3UDR8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Yipf3Q3UDR8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Yipf3Q3UDR8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Yipf3Q3UDR8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Yipf3Q3UDR8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Yipf3Q3UDR8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Yipf3Q3UDR8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Yipf3Q3UDR8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Yipf3Q3UDR8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Yipf3Q3UDR8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Yipf3Q3UDR8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Yipf3Q3UDR8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Yipf3Q3UDR8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Yipf3Q3UDR8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Yipf3Q3UDR8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Yipf3Q3UDR8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Yipf3Q3UDR8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Yipf3Q3UDR8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Yipf3Q3UDR8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Yipf3Q3UDR8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Yipf3Q3UDR8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Yipf3Q3UDR8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Yipf3Q3UDR8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Yipf3Q3UDR8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Yipf3Q3UDR8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Yipf3Q3UDR8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Yipf3Q3UDR8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Yipf3Q3UDR8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Yipf3Q3UDR8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Yipf3Q3UDR8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Yipf3Q3UDR8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Yipf3Q3UDR8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Yipf3Q3UDR8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Yipf3Q3UDR8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Yipf3Q3UDR8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Yipf3Q3UDR8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Yipf3Q3UDR8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Yipf3Q3UDR8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Yipf3Q3UDR8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Yipf3Q3UDR8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Yipf3Q3UDR8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Yipf3Q3UDR8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Yipf3Q3UDR8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Yipf3Q3UDR8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Yipf3Q3UDR8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms